More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1451 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1451  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
315 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212954  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1558  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.73 
 
 
312 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  76.19 
 
 
312 aa  494  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.33 
 
 
313 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0839  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.15 
 
 
317 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0673  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.13 
 
 
314 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000671501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.13 
 
 
314 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.49 
 
 
314 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.86 
 
 
314 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.24 
 
 
317 aa  374  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00466763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.86 
 
 
316 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.49 
 
 
314 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.81 
 
 
316 aa  371  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.49 
 
 
316 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  57.32 
 
 
312 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.87 
 
 
321 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.6 
 
 
315 aa  358  9e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
321 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
321 aa  350  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
321 aa  350  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  53.82 
 
 
313 aa  350  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.46 
 
 
313 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
317 aa  349  3e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.51 
 
 
316 aa  348  8e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 
317 aa  348  9e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
318 aa  346  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0172  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.53 
 
 
315 aa  345  6e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
318 aa  345  8e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.98 
 
 
318 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.53 
 
 
315 aa  344  8.999999999999999e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
318 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.98 
 
 
318 aa  342  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.66 
 
 
359 aa  342  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
320 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
320 aa  341  7e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.66 
 
 
320 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  55.45 
 
 
319 aa  340  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
320 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 
316 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
320 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.05 
 
 
331 aa  340  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.66 
 
 
318 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.67 
 
 
312 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.02 
 
 
320 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
318 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.87 
 
 
336 aa  339  4e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.1 
 
 
318 aa  338  5e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697734  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.45 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.17 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.94 
 
 
318 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2105  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.08 
 
 
318 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537624  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.76 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.45 
 
 
319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.08 
 
 
331 aa  336  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 
322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
321 aa  335  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.76 
 
 
331 aa  335  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
322 aa  335  5e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0575408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  55.13 
 
 
321 aa  335  5e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.45 
 
 
323 aa  335  7.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
324 aa  334  9e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
322 aa  334  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000456755  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.7 
 
 
315 aa  334  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
325 aa  334  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.17 
 
 
325 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0607  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.65 
 
 
315 aa  333  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
324 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.7 
 
 
311 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0588  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.65 
 
 
315 aa  332  4e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.67 
 
 
314 aa  332  7.000000000000001e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.29 
 
 
320 aa  332  7.000000000000001e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0283  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.14 
 
 
318 aa  331  8e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.66 
 
 
316 aa  331  9e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.12 
 
 
331 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.319247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.66 
 
 
316 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.58 
 
 
314 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.66 
 
 
316 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.67 
 
 
315 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 
316 aa  329  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 
314 aa  329  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
315 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.4 
 
 
316 aa  329  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
315 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
315 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
315 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3730  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.38 
 
 
316 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.322716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.61 
 
 
317 aa  328  9e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3837  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0797  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97766  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.26 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3173  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283101  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0793  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000256168  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>