More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1610 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
331 aa  677    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  91.54 
 
 
331 aa  624  1e-178  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  88.82 
 
 
337 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15031  ribose-phosphate pyrophosphokinase  82.78 
 
 
331 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0670  ribose-phosphate pyrophosphokinase  82.78 
 
 
331 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00572245  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  82.78 
 
 
331 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.25 
 
 
331 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.85 
 
 
331 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  79.76 
 
 
331 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.64 
 
 
331 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.319247  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  79.05 
 
 
331 aa  534  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.07 
 
 
338 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  75.8 
 
 
338 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.6 
 
 
330 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.57 
 
 
318 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.25 
 
 
330 aa  488  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.57 
 
 
318 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.7 
 
 
330 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.93 
 
 
322 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.84 
 
 
318 aa  371  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
316 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.73 
 
 
315 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
313 aa  364  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.88 
 
 
317 aa  361  9e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  54.98 
 
 
317 aa  360  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.82 
 
 
322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.09 
 
 
315 aa  355  5e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
314 aa  355  6.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.6 
 
 
359 aa  355  6.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  55.56 
 
 
326 aa  354  8.999999999999999e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 
316 aa  349  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
317 aa  348  5e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.63 
 
 
315 aa  348  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
317 aa  348  9e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
317 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
317 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
317 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
317 aa  348  9e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
317 aa  348  9e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
317 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
317 aa  348  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
317 aa  348  9e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
309 aa  347  1e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.14 
 
 
314 aa  346  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.67 
 
 
317 aa  346  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.85 
 
 
319 aa  345  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
314 aa  345  6e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  54.49 
 
 
313 aa  345  8e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.21 
 
 
325 aa  344  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.65 
 
 
316 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
309 aa  343  2e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.53 
 
 
319 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
314 aa  342  4e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
315 aa  342  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.7 
 
 
311 aa  340  2e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.7 
 
 
315 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  55.81 
 
 
312 aa  338  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.33 
 
 
316 aa  339  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.41 
 
 
309 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.02 
 
 
316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.05 
 
 
309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.09 
 
 
315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.67 
 
 
332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.09 
 
 
315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1558  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
312 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2440  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.76 
 
 
337 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.019928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.88 
 
 
315 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.88 
 
 
315 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1935  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.76 
 
 
337 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351672  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.88 
 
 
315 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.88 
 
 
315 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  334  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
313 aa  334  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
318 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.41 
 
 
320 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.41 
 
 
320 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.41 
 
 
320 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.13 
 
 
309 aa  333  2e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
318 aa  333  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.67 
 
 
329 aa  333  3e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  333  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.09 
 
 
318 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  332  4e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  51.77 
 
 
315 aa  332  4e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1919  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  332  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  332  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1913  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
315 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.8749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>