More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2416 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
316 aa  640    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.21 
 
 
317 aa  408  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.99 
 
 
323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.04 
 
 
331 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.34 
 
 
327 aa  402  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.31 
 
 
327 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.69 
 
 
323 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.31 
 
 
323 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.72 
 
 
308 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2923  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.35 
 
 
313 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.14 
 
 
309 aa  372  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.01 
 
 
325 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0421  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.21 
 
 
314 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.88 
 
 
315 aa  362  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
309 aa  358  6e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.55 
 
 
309 aa  358  6e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.33 
 
 
315 aa  357  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0582  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.88 
 
 
313 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
313 aa  356  2.9999999999999997e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.19 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.19 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.72 
 
 
309 aa  355  5e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.4 
 
 
309 aa  355  5.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.23 
 
 
314 aa  354  8.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
313 aa  353  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
311 aa  352  4e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
313 aa  352  4e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.92 
 
 
319 aa  350  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.13 
 
 
314 aa  350  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.773652  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
309 aa  347  1e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
316 aa  346  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.48 
 
 
315 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.03 
 
 
315 aa  345  6e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
319 aa  345  6e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.69 
 
 
313 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.65 
 
 
319 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
316 aa  342  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.14 
 
 
313 aa  342  5.999999999999999e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.65 
 
 
316 aa  341  9e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.37 
 
 
359 aa  340  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.4 
 
 
317 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
314 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
320 aa  339  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.97 
 
 
316 aa  339  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.05 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.46 
 
 
316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3730  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.7 
 
 
316 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.322716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2630  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.24 
 
 
320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
315 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
315 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 
314 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.42 
 
 
317 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.42 
 
 
317 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.42 
 
 
317 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.42 
 
 
317 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.42 
 
 
317 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.42 
 
 
317 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.42 
 
 
317 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.42 
 
 
317 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.42 
 
 
317 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.42 
 
 
317 aa  334  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
308 aa  334  1e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
311 aa  333  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.72 
 
 
314 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 
317 aa  333  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
316 aa  332  4e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
318 aa  332  6e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
313 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
310 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
310 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
310 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
324 aa  331  9e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
310 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
313 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  52.1 
 
 
313 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
313 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
314 aa  330  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.23 
 
 
315 aa  329  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
313 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
313 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.09 
 
 
318 aa  329  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.09 
 
 
318 aa  329  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.44 
 
 
310 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00928462  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.26 
 
 
315 aa  328  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  53.07 
 
 
312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.62 
 
 
320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.62 
 
 
320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
317 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.94 
 
 
330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
323 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.62 
 
 
320 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
313 aa  326  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  50.81 
 
 
321 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
311 aa  325  5e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550032  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
320 aa  325  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.59 
 
 
318 aa  325  5e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 
318 aa  325  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 
318 aa  325  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.13 
 
 
329 aa  325  6e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 
318 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>