More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2553 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
317 aa  634    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.23 
 
 
317 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.28 
 
 
317 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.28 
 
 
317 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  82.85 
 
 
314 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  82.52 
 
 
316 aa  517  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  81.07 
 
 
317 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384244  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  81.61 
 
 
310 aa  518  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  81.39 
 
 
317 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  81.61 
 
 
310 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  81.99 
 
 
311 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  80.97 
 
 
314 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  81.29 
 
 
310 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  80.97 
 
 
328 aa  511  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  79.35 
 
 
310 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.86 
 
 
317 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  80.65 
 
 
310 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.06 
 
 
310 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  80.26 
 
 
314 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.55 
 
 
331 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  80.26 
 
 
314 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  80.26 
 
 
346 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.71 
 
 
310 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.39 
 
 
310 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  79.03 
 
 
310 aa  500  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  79.03 
 
 
310 aa  500  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  75.48 
 
 
310 aa  483  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0971  ribose-phosphate pyrophosphokinase  75.88 
 
 
311 aa  475  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  76.85 
 
 
311 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2438  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.92 
 
 
311 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167005  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70 
 
 
310 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0671  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.83 
 
 
312 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.1 
 
 
310 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1089  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.11 
 
 
326 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0759  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.81 
 
 
310 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2301  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  63.38 
 
 
339 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0976  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.38 
 
 
339 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508643  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2199  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.77 
 
 
339 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3823  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.27 
 
 
339 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2931  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60 
 
 
340 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134005  normal  0.0220495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  60.52 
 
 
312 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.77 
 
 
340 aa  378  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.1 
 
 
318 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697734  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.94 
 
 
315 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.94 
 
 
315 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.36 
 
 
342 aa  368  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.96 
 
 
336 aa  364  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.04 
 
 
318 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.13 
 
 
321 aa  364  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.41 
 
 
314 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 
316 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 
316 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1625  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.81 
 
 
321 aa  362  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.765759  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0283  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.73 
 
 
318 aa  362  6e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.09 
 
 
314 aa  361  8e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 
320 aa  361  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.41 
 
 
318 aa  360  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.41 
 
 
318 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 
316 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.78 
 
 
318 aa  359  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
320 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
320 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0289  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
317 aa  358  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.78 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.78 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.78 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.78 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.78 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.78 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.78 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.33 
 
 
317 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00466763  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.35 
 
 
317 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.47 
 
 
318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 
320 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
315 aa  355  3.9999999999999996e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.21 
 
 
316 aa  355  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.21 
 
 
317 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
321 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.57 
 
 
316 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.57 
 
 
316 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
315 aa  352  4e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.59 
 
 
310 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0172  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 
315 aa  350  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.4 
 
 
324 aa  350  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.49 
 
 
320 aa  350  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.49 
 
 
325 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 
312 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
316 aa  349  4e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.26 
 
 
316 aa  348  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
321 aa  348  6e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
321 aa  348  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  56.31 
 
 
321 aa  348  6e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.77 
 
 
313 aa  348  9e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.66 
 
 
314 aa  348  9e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.1 
 
 
316 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.77 
 
 
321 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  55.48 
 
 
313 aa  347  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>