More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1015 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
309 aa  628  1e-179  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  92.88 
 
 
309 aa  593  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  89.64 
 
 
309 aa  566  1e-160  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.17 
 
 
309 aa  529  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  82.32 
 
 
311 aa  522  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  79.29 
 
 
309 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  79.29 
 
 
309 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.96 
 
 
309 aa  510  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.96 
 
 
309 aa  508  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.9 
 
 
308 aa  456  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.42 
 
 
320 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
318 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
318 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
318 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
318 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
318 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
318 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
318 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.84 
 
 
318 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  368  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
315 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1913  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.8749 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.84 
 
 
320 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1919  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  368  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 
318 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
324 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 
318 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
320 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
320 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.03 
 
 
323 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  55.91 
 
 
315 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
320 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
315 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.12 
 
 
315 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
315 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2440  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
337 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.019928  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  57.14 
 
 
321 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.77 
 
 
311 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
314 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
315 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
313 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 
318 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.56 
 
 
320 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  58.33 
 
 
312 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.56 
 
 
318 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1935  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
337 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351672  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.56 
 
 
325 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 
316 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.83 
 
 
313 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
315 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127042  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 
316 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.17 
 
 
310 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.01 
 
 
315 aa  366  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.56 
 
 
320 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.14 
 
 
315 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 
315 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 
317 aa  364  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.47 
 
 
336 aa  364  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  55.91 
 
 
313 aa  364  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.02 
 
 
311 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 
314 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.91 
 
 
316 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
313 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 
313 aa  362  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
313 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.27 
 
 
313 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.74 
 
 
322 aa  362  5.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.88 
 
 
324 aa  362  6e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  57.88 
 
 
319 aa  361  7.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
310 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
310 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
310 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.88 
 
 
324 aa  361  9e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.69 
 
 
332 aa  360  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.33 
 
 
315 aa  360  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0289  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.91 
 
 
317 aa  360  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.73 
 
 
316 aa  360  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.33 
 
 
315 aa  360  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
316 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0172  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.17 
 
 
315 aa  360  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093989 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
314 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 
321 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  58.2 
 
 
321 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
310 aa  359  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00928462  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>