More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1408 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  98.26 
 
 
287 aa  573  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  98.95 
 
 
287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  85.37 
 
 
287 aa  509  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.37 
 
 
293 aa  378  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.77 
 
 
282 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.231017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.56 
 
 
283 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0087  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.64 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.11 
 
 
282 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.86 
 
 
290 aa  204  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0775  hypothetical protein  41.26 
 
 
281 aa  204  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000000110897  hitchhiker  0.00000000000484536 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.79 
 
 
285 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.78 
 
 
282 aa  202  7e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.98 
 
 
291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.3 
 
 
282 aa  199  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.683749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.31 
 
 
281 aa  199  7e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2178  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.81 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.115162  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.77 
 
 
281 aa  193  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0975  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.37 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221596  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0317  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.86 
 
 
276 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.300322  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.74 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0660085  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1544  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.42 
 
 
279 aa  172  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.09 
 
 
325 aa  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.13 
 
 
325 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.21 
 
 
309 aa  170  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.55 
 
 
311 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.38 
 
 
309 aa  169  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.23 
 
 
316 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.32 
 
 
322 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.21 
 
 
309 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0834  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.81 
 
 
280 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.64 
 
 
325 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.08 
 
 
309 aa  166  5e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.73 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.66 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.5 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.45 
 
 
322 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.51 
 
 
313 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1288  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35 
 
 
326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959513 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.91 
 
 
326 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0656  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.55 
 
 
323 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.06 
 
 
315 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.36 
 
 
322 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.11 
 
 
317 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.84 
 
 
308 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.01 
 
 
324 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.69 
 
 
317 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.92 
 
 
322 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.53 
 
 
309 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.53 
 
 
309 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.93 
 
 
327 aa  159  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.56 
 
 
325 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0987  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.27 
 
 
326 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.44 
 
 
310 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.53 
 
 
309 aa  159  7e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.91 
 
 
326 aa  159  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.73 
 
 
317 aa  158  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.73 
 
 
317 aa  158  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.73 
 
 
317 aa  158  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.73 
 
 
317 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.73 
 
 
317 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.73 
 
 
317 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.73 
 
 
317 aa  158  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.73 
 
 
317 aa  158  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.73 
 
 
317 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.8 
 
 
312 aa  158  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30170  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.82 
 
 
327 aa  158  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.35865  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.73 
 
 
317 aa  158  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.19 
 
 
310 aa  158  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.16 
 
 
309 aa  157  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.49 
 
 
329 aa  158  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.8 
 
 
312 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.35 
 
 
315 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.63 
 
 
314 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.59 
 
 
310 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3962  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.04 
 
 
324 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
310 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.96 
 
 
314 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0909  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.59 
 
 
347 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.31 
 
 
315 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.44 
 
 
329 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0881  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.55 
 
 
327 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.328682 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  33.94 
 
 
317 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.86 
 
 
286 aa  155  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0430198 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1175  ribose-phosphate diphosphokinase  32 
 
 
337 aa  155  6e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3195  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.3 
 
 
325 aa  155  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.22 
 
 
310 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.79 
 
 
319 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0169  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.94 
 
 
326 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1943  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.59 
 
 
326 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.985471 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.31 
 
 
315 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0060  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.56 
 
 
319 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.124219  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.31 
 
 
315 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.55 
 
 
311 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.56 
 
 
316 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.31 
 
 
315 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  34.31 
 
 
315 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3130  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.92 
 
 
324 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1935  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.31 
 
 
337 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351672  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2030  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.56 
 
 
319 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>