More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1398 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  86.76 
 
 
287 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  86.06 
 
 
287 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  85.37 
 
 
287 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.28 
 
 
293 aa  375  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.01 
 
 
282 aa  225  7e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.231017  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0775  hypothetical protein  41.11 
 
 
281 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000000110897  hitchhiker  0.00000000000484536 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.75 
 
 
283 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.42 
 
 
282 aa  209  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0087  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.22 
 
 
284 aa  206  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.98 
 
 
291 aa  200  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.3 
 
 
285 aa  199  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.77 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.89 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.683749 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.74 
 
 
290 aa  196  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.72 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0317  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.92 
 
 
276 aa  187  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.300322  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2178  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.06 
 
 
284 aa  187  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.115162  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.11 
 
 
281 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0975  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.44 
 
 
279 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221596  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.36 
 
 
294 aa  175  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0660085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.29 
 
 
311 aa  169  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1544  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.38 
 
 
279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.39 
 
 
322 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3458  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  32.16 
 
 
298 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.021419  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.29 
 
 
309 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3877  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  30.5 
 
 
326 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.69 
 
 
286 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0430198 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0834  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.65 
 
 
280 aa  156  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1774  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.45 
 
 
292 aa  155  8e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.19 
 
 
313 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.22 
 
 
309 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.55 
 
 
315 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.61 
 
 
313 aa  152  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.25 
 
 
322 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.82 
 
 
325 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.21 
 
 
309 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.96 
 
 
310 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.63 
 
 
309 aa  151  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.94 
 
 
309 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.94 
 
 
309 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.91 
 
 
310 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
315 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.48 
 
 
325 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3130  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.67 
 
 
324 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.94 
 
 
309 aa  149  6e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.62 
 
 
308 aa  149  6e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.99 
 
 
308 aa  149  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.11 
 
 
310 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.14 
 
 
315 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.59 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.57 
 
 
312 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3689  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00564575  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.8 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.25 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.8 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.57 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.96 
 
 
325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0656  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.75 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.09 
 
 
314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.66 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3463  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33 
 
 
315 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281933  normal  0.770216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.74 
 
 
310 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.53 
 
 
325 aa  146  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.95 
 
 
309 aa  145  6e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.1 
 
 
317 aa  145  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0386  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.21 
 
 
275 aa  145  9e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
315 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2440  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
337 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.019928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
315 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.07 
 
 
327 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1913  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
315 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.8749 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
315 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
315 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.66 
 
 
324 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000010971  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
315 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3173  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.32 
 
 
315 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283101  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0793  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.32 
 
 
315 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000256168  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
315 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  33.7 
 
 
315 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.32 
 
 
315 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1919  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
315 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
315 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1935  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
337 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351672  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
315 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.32 
 
 
315 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3837  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.32 
 
 
315 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0797  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.32 
 
 
315 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97766  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.32 
 
 
315 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.32 
 
 
315 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1943  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.16 
 
 
326 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.985471 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.32 
 
 
315 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1288  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.45 
 
 
326 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
315 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.72 
 
 
316 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.9 
 
 
336 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>