More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3877 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3877  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  100 
 
 
326 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3458  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  67.01 
 
 
298 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.021419  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2472  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  58.04 
 
 
299 aa  316  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1506  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  51.22 
 
 
299 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0190  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50.69 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2689  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  49.83 
 
 
299 aa  265  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1193  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50.17 
 
 
301 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5324  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  49.48 
 
 
301 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1710  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  49.48 
 
 
301 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2358  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  42.55 
 
 
303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4380  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  45.67 
 
 
313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975377  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4512  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  45.67 
 
 
313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0398112  normal  0.511989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0202  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  44.64 
 
 
320 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2240  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  45.83 
 
 
301 aa  222  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3540  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  42.52 
 
 
299 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1716  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  41.9 
 
 
289 aa  192  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0386  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.29 
 
 
275 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4626  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  41.54 
 
 
303 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2496  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  42.5 
 
 
305 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000223709 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3582  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.38 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1442  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  40.14 
 
 
304 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0541473  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1899  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  34.56 
 
 
306 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.99 
 
 
287 aa  160  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.28 
 
 
287 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.28 
 
 
287 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.93 
 
 
287 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1544  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.25 
 
 
279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.29 
 
 
283 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.26 
 
 
293 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.89 
 
 
282 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4122  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.79 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0525218 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0775  hypothetical protein  31.91 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000000110897  hitchhiker  0.00000000000484536 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.53 
 
 
282 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.71 
 
 
282 aa  122  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.683749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.69 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  31.09 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.14 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  29.07 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.05 
 
 
294 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0660085  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.67 
 
 
281 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.98 
 
 
313 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.71 
 
 
309 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.36 
 
 
317 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0087  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.01 
 
 
284 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.71 
 
 
285 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.34 
 
 
313 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0764  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.73 
 
 
361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.45 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2178  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.83 
 
 
284 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.115162  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.48 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.92 
 
 
329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.77 
 
 
331 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.42 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.15 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0670  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.21 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00572245  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.07 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15031  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.21 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.26 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.07 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.9 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.231017  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.65 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.62 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.62 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.319247  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.21 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0430198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.14 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.99 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.48 
 
 
314 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.24 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.55 
 
 
318 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.74 
 
 
331 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.01 
 
 
312 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.55 
 
 
318 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.27 
 
 
281 aa  113  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.06 
 
 
331 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0965  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.62 
 
 
315 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.365189  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.37 
 
 
337 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.57 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.81 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.15 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.11 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.47 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.15 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.78 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.15 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.15 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.28 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.08 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.44 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.15 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.72 
 
 
315 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.72 
 
 
315 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1747  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.21 
 
 
285 aa  110  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.400823  normal  0.232967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.72 
 
 
315 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.61 
 
 
330 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.84 
 
 
309 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.72 
 
 
315 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3463  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.15 
 
 
315 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281933  normal  0.770216 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.55 
 
 
359 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.85 
 
 
312 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.81 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>