More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3582 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3582  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
298 aa  579  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4626  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50 
 
 
303 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1716  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50.35 
 
 
289 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1442  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  48.1 
 
 
304 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0541473  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1899  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  44.44 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3540  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  51.99 
 
 
299 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2240  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  48.12 
 
 
301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2496  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  42.76 
 
 
305 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000223709 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2689  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  40.21 
 
 
299 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1193  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  42.05 
 
 
301 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1506  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  38.99 
 
 
299 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0190  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  40.62 
 
 
305 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3458  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  41.5 
 
 
298 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.021419  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0386  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.24 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2358  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  34.11 
 
 
303 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3877  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  40.71 
 
 
326 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2472  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  41.73 
 
 
299 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5324  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  42.91 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1710  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  42.91 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4380  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  40.07 
 
 
313 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975377  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4512  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  40.07 
 
 
313 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0398112  normal  0.511989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0202  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  39.76 
 
 
320 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0833  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.63 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.512695 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.01 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1747  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.08 
 
 
285 aa  120  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.400823  normal  0.232967 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0380  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.21 
 
 
285 aa  119  9e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.447265  normal  0.0607873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.99 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.8 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.87 
 
 
327 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.99 
 
 
312 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.59 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1347  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0988459 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.09 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.54 
 
 
316 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.54 
 
 
281 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1625  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.4 
 
 
321 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.765759  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1774  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.08 
 
 
292 aa  112  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.06 
 
 
321 aa  112  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.32 
 
 
282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0816  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.68 
 
 
305 aa  110  3e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.72 
 
 
290 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0764  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.48 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.92 
 
 
287 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.97 
 
 
310 aa  109  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.97 
 
 
310 aa  109  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.55 
 
 
287 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.58 
 
 
310 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.63 
 
 
310 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1127  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.96 
 
 
297 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.55 
 
 
287 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.08 
 
 
282 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.683749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.74 
 
 
322 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.54 
 
 
311 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0971  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.16 
 
 
311 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.21 
 
 
315 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.21 
 
 
315 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3823  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.06 
 
 
339 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.31 
 
 
316 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.18 
 
 
323 aa  106  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1089  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.72 
 
 
326 aa  106  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.16 
 
 
317 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.14 
 
 
317 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.4 
 
 
317 aa  106  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.43 
 
 
281 aa  106  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.87 
 
 
321 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.25 
 
 
318 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0975  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.93 
 
 
279 aa  105  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221596  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.31 
 
 
314 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.57 
 
 
309 aa  105  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.21 
 
 
309 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.22 
 
 
331 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  30.8 
 
 
313 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.98 
 
 
285 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.85 
 
 
316 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.33 
 
 
314 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.24 
 
 
316 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.6 
 
 
326 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.83 
 
 
309 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0965  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.01 
 
 
315 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.365189  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.85 
 
 
316 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  28.87 
 
 
312 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.93 
 
 
310 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.91 
 
 
320 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.23 
 
 
317 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.84 
 
 
331 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.69 
 
 
314 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.19 
 
 
331 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30 
 
 
318 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.01 
 
 
318 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.01 
 
 
318 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.74 
 
 
317 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.01 
 
 
318 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.01 
 
 
318 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.3 
 
 
309 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.01 
 
 
318 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.01 
 
 
318 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.01 
 
 
318 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_4059  predicted protein  29.28 
 
 
312 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>