More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3823 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3823  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 		 339 aa  695    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2301  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  84.52 
 
 		 339 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0976  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.52 
 
 		 339 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2199  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.33 
 
 		 339 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.4 
 
 		 340 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  79.04 
 
 		 342 aa  559  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2931  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.34 
 
 		 340 aa  554  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134005  normal  0.0220495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.19 
 
 		 310 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.04 
 
 		 310 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.04 
 
 		 310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.78 
 
 		 317 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.72 
 
 		 314 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.41 
 
 		 316 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.72 
 
 		 310 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.41 
 
 		 310 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.09 
 
 		 311 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65 
 
 		 314 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.78 
 
 		 310 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.72 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.2 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.2 
 
 		 314 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.27 
 
 		 317 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.21 
 
 		 317 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.15 
 
 		 310 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.83 
 
 		 328 aa  388  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.83 
 
 		 310 aa  389  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.15 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.46 
 
 		 310 aa  391  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0971  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.13 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.46 
 
 		 310 aa  391  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.15 
 
 		 317 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.83 
 
 		 310 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.89 
 
 		 317 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.21 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.64 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384244  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.82 
 
 		 311 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2438  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.38 
 
 		 311 aa  371  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167005  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.13 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1089  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.72 
 
 		 326 aa  364  1e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.41 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0671  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.82 
 
 		 312 aa  363  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.41 
 
 		 311 aa  358  8e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  55 
 
 		 312 aa  352  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 		 310 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.73 
 
 		 316 aa  346  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.89 
 
 		 313 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.27 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.58 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.29 
 
 		 315 aa  343  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.29 
 
 		 315 aa  343  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 		 310 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 		 310 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 		 310 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 		 316 aa  342  5.999999999999999e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 		 310 aa  341  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00928462  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.48 
 
 		 314 aa  341  8e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 		 316 aa  341  9e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.8 
 
 		 313 aa  341  9e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53 
 
 		 318 aa  341  9e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.27 
 
 		 313 aa  340  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.35 
 
 		 313 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0759  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.66 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 		 318 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.16 
 
 		 314 aa  338  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 		 320 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 		 320 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.89 
 
 		 336 aa  338  9e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 		 318 aa  338  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.06 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.16 
 
 		 316 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.94 
 
 		 324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.48 
 
 		 316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 		 318 aa  335  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.17 
 
 		 315 aa  335  7.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.16 
 
 		 316 aa  334  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  54.11 
 
 		 321 aa  334  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 		 318 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.38 
 
 		 317 aa  335  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.96 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.96 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 		 320 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.57 
 
 		 312 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 		 318 aa  333  3e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.48 
 
 		 318 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.25 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  54.57 
 
 		 319 aa  332  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 		 320 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.46 
 
 		 314 aa  332  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.48 
 
 		 316 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 		 318 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.48 
 
 		 316 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 		 318 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 		 318 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 		 318 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.61 
 
 		 316 aa  332  8e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 		 318 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 		 318 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.77 
 
 		 309 aa  332  8e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.8 
 
 		 318 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>