More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2472 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2472  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  100 
 
 		 299 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3877  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  58.99 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3458  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  58.39 
 
 		 298 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0190  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  51.53 
 
 		 305 aa  295  5e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1193  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  52.26 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1506  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  49.66 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2689  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  51.71 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5324  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50.34 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1710  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50.34 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2358  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  44.64 
 
 		 303 aa  261  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0202  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  46.08 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4512  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  43.2 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0398112  normal  0.511989 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4380  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  43.2 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2240  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  42.52 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1716  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  43.84 
 
 		 289 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3540  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  41.98 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2496  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  42.52 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000223709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4626  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  41.94 
 
 		 303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1442  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  40 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0541473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3582  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.73 
 
 		 298 aa  158  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0386  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.13 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1899  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  34.84 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.42 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.45 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.69 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.12 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.5 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.88 
 
 		 294 aa  123  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0660085  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.35 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.83 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.71 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.683749 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.37 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.95 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0775  hypothetical protein  29.78 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000000110897  hitchhiker  0.00000000000484536 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.77 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0430198 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1747  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.52 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.400823  normal  0.232967 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1347  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.83 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0988459 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.75 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.85 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.18 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.72 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.33 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.6 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2178  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.62 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.115162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.03 
 
 		 281 aa  99  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 321 aa  99  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.6 
 
 		 321 aa  99  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.62 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.03 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4122  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.29 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0525218 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1544  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.12 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.29 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0087  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.69 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.13 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.93 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0380  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.17 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.447265  normal  0.0607873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1127  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.87 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0317  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.77 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.300322  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.72 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.8 
 
 		 314 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 319 aa  96.3  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.23 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.14 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.14 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.45 
 
 		 324 aa  95.9  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.44 
 
 		 314 aa  95.9  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.8 
 
 		 346 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.04 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.95 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0965  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.8 
 
 		 315 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.365189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.72 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.75 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.71 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.62 
 
 		 309 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.21 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.61 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.8 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.04 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.37 
 
 		 342 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.27 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.03 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0975  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.04 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3823  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.72 
 
 		 339 aa  93.2  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.67 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0764  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.89 
 
 		 361 aa  92.8  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1425  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.45 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000869959  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.1 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.1 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.4 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.04 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384244  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.74 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.18 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.231017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.87 
 
 		 309 aa  90.1  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.5 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.26 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>