More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2689 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2689  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  100 
 
 
299 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1506  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  70.9 
 
 
299 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1193  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  56.79 
 
 
301 aa  322  7e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0190  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  53.06 
 
 
305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2358  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  47.87 
 
 
303 aa  297  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1710  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  53.56 
 
 
301 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5324  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  53.56 
 
 
301 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2472  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  51.71 
 
 
299 aa  291  8e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3877  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50.9 
 
 
326 aa  272  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4512  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  51.64 
 
 
313 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0398112  normal  0.511989 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4380  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  51.64 
 
 
313 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975377  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3458  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  47.93 
 
 
298 aa  255  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.021419  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0202  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  46.92 
 
 
320 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3540  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  40.48 
 
 
299 aa  193  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2240  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  40.77 
 
 
301 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2496  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  43.64 
 
 
305 aa  185  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000223709 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3582  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.21 
 
 
298 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1716  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  39.1 
 
 
289 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4626  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  38.49 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1442  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  39.03 
 
 
304 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0541473  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1899  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  36.47 
 
 
306 aa  165  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0386  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.21 
 
 
275 aa  143  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.01 
 
 
287 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.72 
 
 
290 aa  126  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.09 
 
 
287 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.72 
 
 
287 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.72 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.82 
 
 
283 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.19 
 
 
293 aa  117  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.48 
 
 
294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0660085  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.59 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.683749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.1 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0087  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.63 
 
 
284 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1774  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.09 
 
 
292 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0775  hypothetical protein  29.73 
 
 
281 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000000110897  hitchhiker  0.00000000000484536 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.29 
 
 
331 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.27 
 
 
282 aa  104  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0764  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.36 
 
 
361 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  27.47 
 
 
312 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.69 
 
 
314 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.29 
 
 
315 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.29 
 
 
315 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0975  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
279 aa  102  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221596  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.45 
 
 
318 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.49 
 
 
315 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.3 
 
 
313 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.8 
 
 
282 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2178  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.83 
 
 
284 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.115162  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.11 
 
 
281 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.94 
 
 
315 aa  99  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.94 
 
 
315 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.94 
 
 
315 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0317  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.06 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.300322  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.13 
 
 
315 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.04 
 
 
281 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.53 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4122  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.82 
 
 
311 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0525218 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.83 
 
 
325 aa  97.1  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.28 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.53 
 
 
315 aa  95.9  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.18 
 
 
309 aa  95.9  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.1 
 
 
286 aa  95.9  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0430198 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.86 
 
 
331 aa  95.9  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.53 
 
 
315 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1913  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.53 
 
 
315 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.8749 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.53 
 
 
315 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.09 
 
 
316 aa  95.5  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.53 
 
 
315 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1919  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.53 
 
 
315 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.53 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2440  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.53 
 
 
337 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.019928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.53 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  27.53 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.53 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1935  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.53 
 
 
337 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351672  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.53 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.53 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.92 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0380  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.04 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.447265  normal  0.0607873 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.13 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.44 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1544  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.41 
 
 
279 aa  94  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.64 
 
 
309 aa  94  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.77 
 
 
285 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.54 
 
 
309 aa  94  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0183  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.96 
 
 
331 aa  93.2  4e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.59 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.27 
 
 
309 aa  93.2  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1347  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.65 
 
 
284 aa  93.2  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0988459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.91 
 
 
315 aa  93.2  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.55 
 
 
314 aa  93.2  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.93 
 
 
319 aa  92.4  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.27 
 
 
309 aa  92.4  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7042  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.27 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0827944  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.27 
 
 
314 aa  91.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1747  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.08 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.400823  normal  0.232967 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.55 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.34 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.27 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.83 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>