More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2059 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
319 aa  625  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2878  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.5 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.5 
 
 
329 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0918  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.62 
 
 
328 aa  341  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0983  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.58 
 
 
332 aa  338  8e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46210  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.98 
 
 
326 aa  335  7.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.14 
 
 
335 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7042  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.26 
 
 
321 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0827944  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3009  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.8 
 
 
319 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2744  ribose-phosphate pyrophosphokinase family protein  50.8 
 
 
319 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11994  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1465  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.77 
 
 
327 aa  299  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1731  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.92 
 
 
325 aa  293  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.589505  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3606  hypothetical protein  54.94 
 
 
347 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813853  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.22 
 
 
312 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  36.04 
 
 
312 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.58 
 
 
312 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.8 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.62 
 
 
312 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.54 
 
 
359 aa  165  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.45 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  32.62 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  32.29 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.78 
 
 
313 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3823  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.75 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.75 
 
 
319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.69 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.55 
 
 
314 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.54 
 
 
321 aa  162  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.09 
 
 
329 aa  162  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.97 
 
 
316 aa  162  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.29 
 
 
342 aa  162  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.44 
 
 
314 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.45 
 
 
340 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0160  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  32.5 
 
 
336 aa  162  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.08 
 
 
324 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.584149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.5 
 
 
322 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.08 
 
 
318 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.08 
 
 
318 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.84 
 
 
340 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0702588  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.12 
 
 
318 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.65 
 
 
316 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.44 
 
 
330 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  34.2 
 
 
325 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.69 
 
 
310 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.66 
 
 
311 aa  159  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.67 
 
 
314 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.63 
 
 
332 aa  159  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.6 
 
 
330 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.66 
 
 
314 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2931  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.65 
 
 
340 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134005  normal  0.0220495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.74 
 
 
331 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.62 
 
 
316 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4123  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.25 
 
 
310 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0241029 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0183  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.87 
 
 
331 aa  157  2e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.95 
 
 
324 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000010971  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.67 
 
 
326 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.92 
 
 
314 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.3 
 
 
315 aa  156  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.69 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.02 
 
 
316 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1943  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.47 
 
 
326 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.985471 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.1 
 
 
319 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.46 
 
 
313 aa  155  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3130  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.56 
 
 
324 aa  155  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.37 
 
 
325 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.87 
 
 
314 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.28 
 
 
319 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.84 
 
 
312 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3689  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.21 
 
 
324 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00564575  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.87 
 
 
346 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.87 
 
 
314 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.29 
 
 
321 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000509786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.15 
 
 
315 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.33 
 
 
315 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.15 
 
 
315 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1919  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.15 
 
 
315 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.15 
 
 
315 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.15 
 
 
315 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.15 
 
 
315 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  34.15 
 
 
315 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.33 
 
 
315 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.33 
 
 
315 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.33 
 
 
315 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.8 
 
 
319 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.06 
 
 
318 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.33 
 
 
315 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.15 
 
 
315 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1913  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.15 
 
 
315 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.8749 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.15 
 
 
315 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.15 
 
 
315 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.56 
 
 
315 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.92 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2440  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.15 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.019928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.15 
 
 
315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.33 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.01 
 
 
314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4145  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.13 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1935  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.15 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351672  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>