More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5925 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
335 aa  670    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0918  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.02 
 
 
328 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7042  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.29 
 
 
321 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0827944  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2878  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.49 
 
 
329 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.17 
 
 
329 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0983  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.18 
 
 
332 aa  354  1e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1465  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.49 
 
 
327 aa  345  8.999999999999999e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1731  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.4 
 
 
325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.14 
 
 
319 aa  306  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46210  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.38 
 
 
326 aa  279  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.73 
 
 
328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.589505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2744  ribose-phosphate pyrophosphokinase family protein  45.81 
 
 
319 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11994  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3009  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.81 
 
 
319 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3606  hypothetical protein  45 
 
 
347 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813853  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.75 
 
 
312 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.44 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.2 
 
 
340 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0702588  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.87 
 
 
312 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.84 
 
 
323 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.02 
 
 
314 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0609  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.27 
 
 
324 aa  186  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.88 
 
 
314 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.25 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.69 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.28 
 
 
316 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.68 
 
 
312 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.01 
 
 
326 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.13 
 
 
316 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.6 
 
 
329 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.89 
 
 
316 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.9 
 
 
322 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.5 
 
 
327 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.65 
 
 
316 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  37.46 
 
 
312 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.04 
 
 
325 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  33.53 
 
 
326 aa  176  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.65 
 
 
316 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0789  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.56 
 
 
326 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.2 
 
 
313 aa  176  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.93 
 
 
326 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.82 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.88 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.11 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0160  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  34.04 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.64 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.85 
 
 
317 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.14 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.23 
 
 
322 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0670  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.14 
 
 
331 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00572245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.45 
 
 
313 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.76 
 
 
315 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2281  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.49 
 
 
313 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000349824  hitchhiker  0.0000000850288 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15031  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.14 
 
 
331 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.06 
 
 
315 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.64 
 
 
308 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.92 
 
 
326 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.49 
 
 
324 aa  170  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.584149  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.09 
 
 
318 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.64 
 
 
322 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.34 
 
 
326 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.09 
 
 
318 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.29 
 
 
338 aa  169  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.62 
 
 
327 aa  169  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.66 
 
 
330 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.85 
 
 
338 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.51 
 
 
331 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.65 
 
 
326 aa  168  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.09 
 
 
321 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1290  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.98 
 
 
326 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.4 
 
 
331 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.04 
 
 
319 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.04 
 
 
319 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.93 
 
 
325 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.34 
 
 
331 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.19 
 
 
331 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.319247  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34307  Ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.6 
 
 
323 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.362239  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.95 
 
 
331 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.38 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.45 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0452  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.74 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.235011 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  32.82 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.35 
 
 
323 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  33.87 
 
 
325 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.88 
 
 
324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000010971  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.39 
 
 
331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.23 
 
 
314 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.6 
 
 
311 aa  166  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.72 
 
 
315 aa  165  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1545  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.85 
 
 
325 aa  166  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.317921  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.87 
 
 
331 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30170  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.28 
 
 
327 aa  165  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.35865  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  37.35 
 
 
319 aa  165  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.72 
 
 
315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.76 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.73 
 
 
324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.48 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.96 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>