More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7042 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7042  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
321 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0827944  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0918  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.93 
 
 
328 aa  424  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.29 
 
 
335 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2878  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.63 
 
 
329 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53 
 
 
329 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1465  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 
327 aa  318  7e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0983  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.93 
 
 
332 aa  315  7e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.26 
 
 
319 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2744  ribose-phosphate pyrophosphokinase family protein  47.92 
 
 
319 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11994  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3009  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.24 
 
 
319 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46210  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.35 
 
 
326 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1731  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.06 
 
 
325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.63 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.589505  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3606  hypothetical protein  43.42 
 
 
347 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813853  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  38.49 
 
 
326 aa  195  9e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.61 
 
 
316 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.54 
 
 
312 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.66 
 
 
315 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  36.16 
 
 
327 aa  191  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.22 
 
 
312 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.67 
 
 
316 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.82 
 
 
315 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.85 
 
 
317 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.22 
 
 
317 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.22 
 
 
317 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.22 
 
 
317 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.22 
 
 
317 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.22 
 
 
317 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.22 
 
 
317 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.22 
 
 
317 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.22 
 
 
317 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.22 
 
 
317 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.22 
 
 
317 aa  188  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.36 
 
 
326 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.98 
 
 
329 aa  187  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.14 
 
 
316 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.01 
 
 
340 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0702588  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.3 
 
 
314 aa  185  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.66 
 
 
322 aa  185  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.33 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.06 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.78 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.6 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.68 
 
 
312 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.34 
 
 
314 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.6 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.56 
 
 
325 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.63 
 
 
318 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.63 
 
 
318 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.16 
 
 
326 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.41 
 
 
317 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.09 
 
 
318 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.02 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.49 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.82 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.03 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.82 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1290  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.36 
 
 
326 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.48 
 
 
322 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0789  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.11 
 
 
326 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.42 
 
 
314 aa  179  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.83 
 
 
330 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1453  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.14 
 
 
316 aa  178  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.74 
 
 
318 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0183  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.91 
 
 
331 aa  177  2e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0609  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.52 
 
 
324 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.14 
 
 
316 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.71 
 
 
314 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.83 
 
 
316 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.11 
 
 
314 aa  176  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.66 
 
 
338 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.79 
 
 
326 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.71 
 
 
338 aa  176  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  37.3 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  35.94 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.48 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  34.39 
 
 
317 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.34 
 
 
312 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03490  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.69 
 
 
334 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.489296  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.9 
 
 
327 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.08 
 
 
330 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.11 
 
 
325 aa  170  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.11 
 
 
324 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0160  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  35.67 
 
 
336 aa  169  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.88 
 
 
326 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0138  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.88 
 
 
321 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.056526  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.24 
 
 
324 aa  168  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.584149  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.58 
 
 
311 aa  168  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.13 
 
 
326 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0522  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.11 
 
 
321 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00402651  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.65 
 
 
331 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0535  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.11 
 
 
321 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0143488  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.91 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.66 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0778  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.19 
 
 
332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.42 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.65 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.05 
 
 
337 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.08 
 
 
331 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.91 
 
 
316 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>