More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0983 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0983  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
332 aa  678    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2878  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.34 
 
 
329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.34 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0918  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.15 
 
 
328 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.18 
 
 
335 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1731  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.93 
 
 
325 aa  316  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7042  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.93 
 
 
321 aa  315  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0827944  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.58 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1465  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.91 
 
 
327 aa  300  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2744  ribose-phosphate pyrophosphokinase family protein  47.3 
 
 
319 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11994  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46210  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.51 
 
 
326 aa  285  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3009  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.67 
 
 
319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.53 
 
 
328 aa  276  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.589505  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40 
 
 
312 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.08 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3606  hypothetical protein  40.25 
 
 
347 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813853  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  37.76 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.77 
 
 
312 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.96 
 
 
316 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.65 
 
 
322 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.15 
 
 
312 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.09 
 
 
319 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.78 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.84 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.2 
 
 
316 aa  196  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.44 
 
 
322 aa  195  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.78 
 
 
319 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.91 
 
 
330 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.25 
 
 
314 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32326  predicted protein  37.77 
 
 
309 aa  194  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.89 
 
 
316 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.7 
 
 
317 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.41 
 
 
327 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.49 
 
 
330 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.89 
 
 
314 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.59 
 
 
316 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.28 
 
 
338 aa  193  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.56 
 
 
318 aa  192  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.15 
 
 
313 aa  192  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  36.08 
 
 
327 aa  192  9e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.79 
 
 
331 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.19 
 
 
318 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.23 
 
 
316 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.19 
 
 
318 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  37.35 
 
 
312 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.56 
 
 
340 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0702588  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.39 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0839  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.42 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.57 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.45 
 
 
321 aa  189  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.76 
 
 
309 aa  189  7e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4145  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.24 
 
 
317 aa  189  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.2 
 
 
325 aa  188  9e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0764  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.35 
 
 
361 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.28 
 
 
331 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.96 
 
 
331 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0160  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  34.94 
 
 
336 aa  187  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.49 
 
 
338 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.55 
 
 
331 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.319247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.63 
 
 
317 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.98 
 
 
314 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.53 
 
 
323 aa  186  7e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0614  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.95 
 
 
314 aa  185  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.73 
 
 
324 aa  185  8e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15031  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.77 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0670  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.77 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00572245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.37 
 
 
359 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.48 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.38 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.08 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.37 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.26 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.94 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.73 
 
 
321 aa  183  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000509786  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0043  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.73 
 
 
321 aa  183  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.270111  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.25 
 
 
331 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.58 
 
 
331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36 
 
 
312 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  35.74 
 
 
321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.03 
 
 
329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1451  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.54 
 
 
315 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212954  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.11 
 
 
317 aa  182  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.54 
 
 
324 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.11 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.95 
 
 
315 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0673  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.9 
 
 
314 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000671501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.35 
 
 
321 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.15 
 
 
324 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
315 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.65 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.92 
 
 
315 aa  179  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.45 
 
 
332 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.26 
 
 
315 aa  179  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.55 
 
 
318 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.2 
 
 
313 aa  179  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1453  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.34 
 
 
316 aa  179  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.24 
 
 
318 aa  178  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.24 
 
 
318 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.24 
 
 
320 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.24 
 
 
318 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>