More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4145 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4145  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 		 317 aa  652    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.5 
 
 		 317 aa  331  8e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 		 316 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.21 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 		 315 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.23 
 
 		 318 aa  325  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.21 
 
 		 322 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  52.56 
 
 		 317 aa  323  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.74 
 
 		 314 aa  322  8e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.05 
 
 		 316 aa  316  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 		 313 aa  315  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.96 
 
 		 312 aa  312  5.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.89 
 
 		 323 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 		 322 aa  305  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.89 
 
 		 323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.21 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0839  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 		 317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.25 
 
 		 323 aa  302  5.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  50.79 
 
 		 312 aa  301  7.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.72 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.19 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.13 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.25 
 
 		 331 aa  299  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.94 
 
 		 314 aa  298  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.19 
 
 		 319 aa  299  5e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.57 
 
 		 327 aa  298  6e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.92 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.56 
 
 		 331 aa  298  7e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.92 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.77 
 
 		 315 aa  298  8e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.78 
 
 		 327 aa  298  9e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 316 aa  298  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.47 
 
 		 327 aa  297  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 316 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.94 
 
 		 314 aa  296  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.25 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.44 
 
 		 323 aa  297  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.24 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.74 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0759  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.64 
 
 		 310 aa  296  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.4 
 
 		 338 aa  296  4e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.67 
 
 		 317 aa  295  7e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.06 
 
 		 309 aa  295  8e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 		 324 aa  295  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.25 
 
 		 314 aa  295  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0435  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.2 
 
 		 324 aa  295  9e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.187137  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.92 
 
 		 331 aa  295  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.319247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.35 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.35 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.35 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.35 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.35 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.35 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.35 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.35 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.35 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.35 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.89 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.35 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.48 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.35 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.1 
 
 		 316 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.92 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.77 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.63 
 
 		 316 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.86 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.86 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.86 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.86 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.86 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.86 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.86 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 321 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 		 321 aa  293  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.47 
 
 		 329 aa  292  4e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.42 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  48.72 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.23 
 
 		 318 aa  291  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.9 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_377  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.57 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.94 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.94 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.95 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.94 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.28 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.65 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 319 aa  289  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1288  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.18 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.77 
 
 		 331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.3 
 
 		 313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 		 313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>