More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0435 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0435  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
324 aa  660    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.187137  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  95.68 
 
 
324 aa  639    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_377  ribose-phosphate pyrophosphokinase  97.53 
 
 
324 aa  649    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0778  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.7 
 
 
332 aa  364  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.45 
 
 
325 aa  359  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.25 
 
 
316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.68 
 
 
317 aa  355  5e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.53 
 
 
322 aa  350  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
315 aa  349  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
315 aa  348  9e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
313 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
315 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
318 aa  343  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 
316 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
317 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2621  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.8 
 
 
324 aa  341  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.065708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.58 
 
 
314 aa  341  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4537  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
327 aa  341  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.21 
 
 
322 aa  339  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0083  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.21 
 
 
327 aa  335  5.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0312629 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  50.48 
 
 
317 aa  335  7e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
314 aa  333  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.05 
 
 
327 aa  332  4e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.26 
 
 
359 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.58 
 
 
316 aa  329  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.58 
 
 
316 aa  328  6e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
318 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
318 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.87 
 
 
319 aa  323  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 
330 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0839  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
317 aa  320  3e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
319 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 
331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0614  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.06 
 
 
314 aa  318  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.06 
 
 
338 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 
316 aa  317  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.41 
 
 
338 aa  317  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
314 aa  315  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.03 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.96 
 
 
317 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00466763  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
315 aa  312  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 
314 aa  311  7.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50.48 
 
 
327 aa  310  2e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  47.78 
 
 
321 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.41 
 
 
314 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2630  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.76 
 
 
320 aa  309  5e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
329 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.09 
 
 
314 aa  308  8e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 
315 aa  308  8e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 
315 aa  308  8e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.08 
 
 
324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  49.51 
 
 
321 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.51 
 
 
321 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.09 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.03 
 
 
320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  50.16 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.08 
 
 
324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 
324 aa  305  8.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.17 
 
 
325 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
316 aa  305  9.000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.64 
 
 
329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  48.08 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.13 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
320 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2735  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.1 
 
 
308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.38 
 
 
321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.38 
 
 
321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.38 
 
 
321 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1558  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.28 
 
 
312 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.98 
 
 
318 aa  302  6.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.39 
 
 
312 aa  301  9e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.59 
 
 
321 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.62 
 
 
331 aa  301  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.81 
 
 
337 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
316 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
316 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
328 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
318 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
320 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
320 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
310 aa  299  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.41 
 
 
316 aa  299  4e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.44 
 
 
325 aa  299  4e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
320 aa  299  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
318 aa  299  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>