More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0083 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0083  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
327 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0312629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4537  ribose-phosphate pyrophosphokinase  90.8 
 
 
327 aa  600  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0778  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.25 
 
 
332 aa  471  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2621  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.43 
 
 
324 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.065708  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0435  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.21 
 
 
324 aa  335  5.999999999999999e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.187137  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_377  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.21 
 
 
324 aa  334  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.57 
 
 
324 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.69 
 
 
317 aa  322  5e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.04 
 
 
325 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.64 
 
 
316 aa  308  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
322 aa  307  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.73 
 
 
316 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.62 
 
 
315 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.45 
 
 
313 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45 
 
 
318 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.94 
 
 
314 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.11 
 
 
320 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.11 
 
 
320 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.11 
 
 
320 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.11 
 
 
320 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0614  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.82 
 
 
314 aa  297  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.11 
 
 
320 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.56 
 
 
322 aa  297  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.94 
 
 
318 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.94 
 
 
318 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.25 
 
 
318 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.94 
 
 
318 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.94 
 
 
318 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.94 
 
 
318 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.94 
 
 
318 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.94 
 
 
318 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.79 
 
 
320 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
313 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.34 
 
 
325 aa  294  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.94 
 
 
318 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.56 
 
 
316 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.62 
 
 
318 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.34 
 
 
317 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.62 
 
 
318 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.44 
 
 
315 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  45.37 
 
 
321 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.01 
 
 
311 aa  289  4e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.44 
 
 
315 aa  288  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.25 
 
 
316 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.45 
 
 
315 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.9 
 
 
329 aa  287  2e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.94 
 
 
316 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.94 
 
 
314 aa  285  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.31 
 
 
318 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.79 
 
 
325 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  46.84 
 
 
313 aa  285  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.34 
 
 
319 aa  285  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.12 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 
314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.55 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.84 
 
 
331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.27 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  43.63 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.49 
 
 
313 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.34 
 
 
319 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.17 
 
 
323 aa  282  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  45.74 
 
 
312 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.65 
 
 
314 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.51 
 
 
327 aa  281  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.3 
 
 
330 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  42.72 
 
 
319 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.55 
 
 
317 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.48 
 
 
316 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.48 
 
 
316 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.51 
 
 
321 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  42.51 
 
 
321 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.96 
 
 
317 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.17 
 
 
359 aa  279  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.55 
 
 
317 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.55 
 
 
317 aa  278  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.55 
 
 
317 aa  278  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.55 
 
 
317 aa  278  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.55 
 
 
317 aa  278  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.55 
 
 
317 aa  278  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.55 
 
 
317 aa  278  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.55 
 
 
317 aa  278  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.55 
 
 
317 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.55 
 
 
317 aa  278  9e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.86 
 
 
316 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.67 
 
 
318 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.11 
 
 
324 aa  277  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  44.14 
 
 
327 aa  278  1e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.9 
 
 
324 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.13 
 
 
321 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2735  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.41 
 
 
308 aa  276  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.65 
 
 
314 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.11 
 
 
315 aa  276  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.13 
 
 
320 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.79 
 
 
315 aa  275  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.79 
 
 
315 aa  275  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.79 
 
 
315 aa  275  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.79 
 
 
315 aa  275  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.79 
 
 
315 aa  275  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  44.79 
 
 
315 aa  275  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.81 
 
 
312 aa  275  6e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>