More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0759 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0759  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
310 aa  622  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0671  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.83 
 
 
312 aa  424  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0971  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.85 
 
 
311 aa  424  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.85 
 
 
311 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.56 
 
 
317 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384244  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.24 
 
 
310 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.13 
 
 
310 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.16 
 
 
310 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.48 
 
 
328 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.84 
 
 
310 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.42 
 
 
310 aa  411  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.84 
 
 
317 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.13 
 
 
317 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.42 
 
 
310 aa  411  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.45 
 
 
310 aa  411  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.84 
 
 
310 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.81 
 
 
310 aa  411  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.67 
 
 
316 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.81 
 
 
317 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.48 
 
 
317 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.99 
 
 
314 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.81 
 
 
317 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.99 
 
 
314 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.84 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.45 
 
 
314 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.84 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.99 
 
 
346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.02 
 
 
314 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.87 
 
 
310 aa  404  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2438  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.52 
 
 
311 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167005  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.84 
 
 
317 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.52 
 
 
311 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.68 
 
 
310 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.03 
 
 
310 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.25 
 
 
315 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.25 
 
 
315 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.44 
 
 
336 aa  355  7.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.56 
 
 
314 aa  354  7.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 
316 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.93 
 
 
315 aa  354  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.33 
 
 
314 aa  353  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.06 
 
 
320 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.06 
 
 
320 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2931  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134005  normal  0.0220495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  56.77 
 
 
313 aa  352  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
321 aa  352  5e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.06 
 
 
320 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 
318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 
318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 
318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 
318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 
318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 
318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 
318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1089  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.91 
 
 
326 aa  352  7e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.37 
 
 
314 aa  351  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
314 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 
311 aa  350  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  58.25 
 
 
312 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.2 
 
 
318 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
320 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 
323 aa  348  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 
318 aa  348  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.74 
 
 
318 aa  348  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.99 
 
 
324 aa  348  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
320 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1625  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 
321 aa  348  7e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.765759  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
320 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
321 aa  347  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000191393  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.59 
 
 
316 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 
312 aa  347  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.59 
 
 
316 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2301  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  55.52 
 
 
339 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0976  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
339 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508643  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 
318 aa  346  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.77 
 
 
315 aa  346  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.88 
 
 
318 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.73 
 
 
332 aa  346  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.34 
 
 
324 aa  345  8e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.09 
 
 
315 aa  345  8e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.63 
 
 
311 aa  344  8.999999999999999e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2199  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.89 
 
 
339 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
325 aa  344  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3730  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 
316 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.322716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 
317 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
316 aa  343  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 
313 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.48 
 
 
313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.39 
 
 
322 aa  342  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
315 aa  342  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0283  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
318 aa  342  5e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3173  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 
315 aa  342  7e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283101  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0793  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 
315 aa  342  7e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000256168  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 
315 aa  342  7e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0289  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.63 
 
 
317 aa  341  9e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.27 
 
 
315 aa  341  9e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.06 
 
 
317 aa  341  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.49 
 
 
309 aa  340  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0797  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 
315 aa  340  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97766  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3823  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.66 
 
 
339 aa  340  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>