More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1155 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
323 aa  655    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  88.24 
 
 
323 aa  579  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  86.69 
 
 
327 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  86.38 
 
 
323 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  86.38 
 
 
327 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  85.53 
 
 
317 aa  549  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.28 
 
 
331 aa  541  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.99 
 
 
316 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.78 
 
 
316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.46 
 
 
316 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.58 
 
 
322 aa  356  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
313 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 
316 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.41 
 
 
325 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.54 
 
 
309 aa  352  4e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
315 aa  352  5.9999999999999994e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.05 
 
 
314 aa  349  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.68 
 
 
311 aa  347  2e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  54.52 
 
 
313 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  57.83 
 
 
327 aa  346  3e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
321 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.88 
 
 
309 aa  344  1e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.37 
 
 
319 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 
321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.99 
 
 
338 aa  342  4e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.77 
 
 
318 aa  342  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 
321 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
314 aa  342  7e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.13 
 
 
321 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
314 aa  341  8e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.02 
 
 
314 aa  341  8e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.17 
 
 
316 aa  341  9e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.37 
 
 
309 aa  340  2e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  52.56 
 
 
321 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.69 
 
 
315 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.69 
 
 
315 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.21 
 
 
309 aa  340  2e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.55 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.48 
 
 
331 aa  338  5e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.66 
 
 
315 aa  338  7e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.34 
 
 
317 aa  338  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.21 
 
 
309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.37 
 
 
309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.66 
 
 
315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2923  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.4 
 
 
313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.02 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.02 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.02 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.02 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.02 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.02 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.02 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.02 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.02 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  55.02 
 
 
312 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
310 aa  335  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.02 
 
 
317 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.88 
 
 
309 aa  335  7e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.55 
 
 
313 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 
319 aa  335  7e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.55 
 
 
313 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.55 
 
 
313 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.22 
 
 
313 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 
309 aa  334  1e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.55 
 
 
311 aa  334  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
314 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
318 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.22 
 
 
313 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
318 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.55 
 
 
310 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
318 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.55 
 
 
310 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.55 
 
 
310 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
318 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  52.75 
 
 
317 aa  333  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
330 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
309 aa  333  3e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
320 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
320 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
330 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
320 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.7 
 
 
315 aa  332  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
319 aa  332  6e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
329 aa  332  6e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.02 
 
 
325 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.57 
 
 
310 aa  331  8e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00928462  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.58 
 
 
318 aa  331  9e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.19 
 
 
316 aa  331  9e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.24 
 
 
323 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.28 
 
 
320 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
320 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.7 
 
 
317 aa  331  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.58 
 
 
318 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.58 
 
 
318 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.58 
 
 
318 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.58 
 
 
308 aa  330  2e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.9 
 
 
320 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.58 
 
 
318 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>