More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1053 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
331 aa  661    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0764  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.58 
 
 
361 aa  503  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4123  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.29 
 
 
310 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0241029 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.78 
 
 
315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.81 
 
 
329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.78 
 
 
315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.64 
 
 
316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  48.59 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
313 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.24 
 
 
329 aa  298  1e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
317 aa  297  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
317 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
317 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
317 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
317 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
317 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
317 aa  294  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
317 aa  294  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
317 aa  294  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
317 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
317 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
317 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.95 
 
 
314 aa  292  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
310 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
315 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.71 
 
 
316 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.92 
 
 
319 aa  289  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  47.62 
 
 
317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.41 
 
 
325 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 
321 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.35 
 
 
310 aa  285  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
318 aa  285  9e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.03 
 
 
310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  46.82 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
310 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.4 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.08 
 
 
314 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.71 
 
 
310 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.56 
 
 
308 aa  281  9e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
321 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
321 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  48.87 
 
 
312 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.95 
 
 
314 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.04 
 
 
309 aa  280  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.04 
 
 
309 aa  280  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.78 
 
 
311 aa  280  3e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.56 
 
 
315 aa  280  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.08 
 
 
309 aa  279  4e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.27 
 
 
315 aa  279  4e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.56 
 
 
322 aa  279  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.71 
 
 
309 aa  279  6e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0609  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.74 
 
 
324 aa  279  6e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.23 
 
 
309 aa  278  7e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0673  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.83 
 
 
314 aa  278  9e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000671501  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
314 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.31 
 
 
322 aa  276  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.71 
 
 
310 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
314 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.22 
 
 
331 aa  276  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.27 
 
 
312 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.57 
 
 
317 aa  276  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.47 
 
 
319 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.91 
 
 
321 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.62 
 
 
317 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0607  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.06 
 
 
315 aa  275  5e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.47 
 
 
313 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.95 
 
 
314 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
314 aa  275  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.73 
 
 
319 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.08 
 
 
315 aa  275  7e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.44 
 
 
331 aa  275  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0588  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.06 
 
 
315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.39 
 
 
309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 
315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.44 
 
 
311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.69 
 
 
316 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.33 
 
 
316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.78 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.23 
 
 
324 aa  272  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.96 
 
 
314 aa  272  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.32 
 
 
342 aa  271  8.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.92 
 
 
315 aa  271  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.01 
 
 
316 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.24 
 
 
315 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.24 
 
 
315 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.24 
 
 
315 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.24 
 
 
315 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.91 
 
 
314 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
315 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
315 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.91 
 
 
346 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.91 
 
 
314 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.56 
 
 
315 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
315 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
315 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>