More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2240 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2240  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  100 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3540  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  63.41 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2496  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  56.29 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000223709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1716  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  48.23 
 
 		 289 aa  258  8e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3877  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  46.1 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3582  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.92 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4626  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  45.52 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3458  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  44.84 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2472  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  42.52 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1442  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  43.64 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0541473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0190  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  38.3 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1899  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  38.21 
 
 		 306 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2358  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  34.98 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1506  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  41.54 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0386  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.47 
 
 		 275 aa  188  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1193  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  38.14 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2689  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  40.77 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5324  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  39.73 
 
 		 301 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1710  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  39.73 
 
 		 301 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4512  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  40.08 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0398112  normal  0.511989 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4380  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  40.08 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0202  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  38.78 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.82 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.82 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.47 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.41 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.53 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.89 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.09 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.56 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.683749 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.14 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.6 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0660085  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0775  hypothetical protein  31.77 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000000110897  hitchhiker  0.00000000000484536 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.64 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.94 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.01 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0087  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.67 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.13 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.87 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.231017  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.41 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.62 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1347  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.86 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0988459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.41 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.1 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0317  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.82 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.300322  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1544  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.62 
 
 		 279 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0380  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.49 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.447265  normal  0.0607873 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1747  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.19 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.400823  normal  0.232967 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1774  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.15 
 
 		 292 aa  106  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0975  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.69 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0421  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.9 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.33 
 
 		 329 aa  102  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0834  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.46 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0833  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.06 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.512695 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0160  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  29.31 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2178  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.9 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.115162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.15 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1175  ribose-phosphate diphosphokinase  32.09 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.15 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.92 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0764  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.95 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.82 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.47 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.91 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.91 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.47 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.1 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2923  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.96 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.47 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.55 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.84 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.28 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1127  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.65 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.87 
 
 		 314 aa  95.9  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.25 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.584149  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  28.97 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.63 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.78 
 
 		 340 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0702588  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  27.1 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.93 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0101  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  27.76 
 
 		 330 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630999  hitchhiker  0.000002029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.93 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.72 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.45 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.45 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.45 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.45 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.45 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.12 
 
 		 317 aa  92.8  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.45 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.45 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.24 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.773652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.45 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.45 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.96 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4122  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.21 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0525218 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.31 
 
 		 321 aa  92.8  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000509786  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.94 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 		 315 aa  92.4  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>