More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0834 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0834  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0087  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.23 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55 
 
 
291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.62 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.683749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1544  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.29 
 
 
279 aa  229  6e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2178  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.94 
 
 
284 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.115162  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.86 
 
 
282 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.231017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.92 
 
 
283 aa  185  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.68 
 
 
282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.81 
 
 
287 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.81 
 
 
287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0775  hypothetical protein  33.81 
 
 
281 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000000110897  hitchhiker  0.00000000000484536 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.81 
 
 
287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.62 
 
 
281 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.43 
 
 
285 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.65 
 
 
287 aa  156  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.12 
 
 
293 aa  153  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.8 
 
 
281 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0975  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.39 
 
 
279 aa  148  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221596  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.81 
 
 
282 aa  138  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1774  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.46 
 
 
292 aa  122  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.04 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.04 
 
 
294 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0660085  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0833  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.75 
 
 
309 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.512695 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3463  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.81 
 
 
315 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281933  normal  0.770216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2240  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  32.46 
 
 
301 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
315 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.94 
 
 
315 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.94 
 
 
315 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.94 
 
 
315 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3130  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.81 
 
 
324 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.94 
 
 
315 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
315 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127042  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.79 
 
 
309 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0317  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.35 
 
 
276 aa  101  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.300322  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
315 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2440  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
337 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.019928  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.94 
 
 
315 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.28 
 
 
315 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
315 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
315 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
315 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.28 
 
 
315 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
315 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
315 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1913  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
315 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.8749 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
315 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1935  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
337 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351672  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
315 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  29.3 
 
 
315 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3689  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.81 
 
 
324 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00564575  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1919  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.3 
 
 
315 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0386  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.56 
 
 
275 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.81 
 
 
324 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000010971  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.97 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.06 
 
 
315 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.06 
 
 
315 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.94 
 
 
315 aa  99  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.06 
 
 
315 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.06 
 
 
315 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.94 
 
 
315 aa  99  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.57 
 
 
315 aa  98.6  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.74 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.37 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.79 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3837  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.68 
 
 
315 aa  96.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0797  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.68 
 
 
315 aa  96.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97766  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0190  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  28.47 
 
 
305 aa  96.3  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3173  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.68 
 
 
315 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283101  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0793  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.68 
 
 
315 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000256168  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.68 
 
 
315 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.68 
 
 
315 aa  95.9  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.04 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3877  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  30.56 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.22 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.46 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.44 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3582  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.42 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1193  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  31.09 
 
 
301 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.28 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.02 
 
 
312 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.55 
 
 
309 aa  93.2  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.59 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3458  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  29.05 
 
 
298 aa  93.2  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.021419  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.94 
 
 
332 aa  93.2  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1716  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  30.95 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.55 
 
 
309 aa  92.4  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.68 
 
 
313 aa  92.4  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.51 
 
 
330 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.36 
 
 
315 aa  92.4  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.14 
 
 
312 aa  92.4  7e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.855019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0987  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.44 
 
 
326 aa  92.4  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257813 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.55 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.71 
 
 
309 aa  92  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0172  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.36 
 
 
315 aa  92  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093989 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.98 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0582  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.02 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02577  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.28 
 
 
315 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000766958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.9 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.31 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>