More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0412 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
282 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.231017  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.12 
 
 
282 aa  299  3e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.06 
 
 
283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.17 
 
 
285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.77 
 
 
287 aa  232  6e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.77 
 
 
287 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.13 
 
 
287 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0775  hypothetical protein  43.27 
 
 
281 aa  231  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000000110897  hitchhiker  0.00000000000484536 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.01 
 
 
287 aa  225  7e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.4 
 
 
281 aa  224  8e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.4 
 
 
293 aa  222  7e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0975  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.85 
 
 
279 aa  221  8e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221596  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.35 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0087  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.51 
 
 
284 aa  212  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.4 
 
 
282 aa  205  8e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0834  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.86 
 
 
280 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.05 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2178  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.86 
 
 
284 aa  192  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.115162  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.96 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.683749 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1774  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.1 
 
 
292 aa  169  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.21 
 
 
290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1544  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.01 
 
 
279 aa  158  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0317  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.08 
 
 
276 aa  157  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.300322  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.22 
 
 
309 aa  152  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.68 
 
 
308 aa  149  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.78 
 
 
323 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.14 
 
 
314 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.21 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0660085  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.54 
 
 
324 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.21 
 
 
324 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
315 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.35 
 
 
309 aa  144  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.53 
 
 
309 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
315 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2440  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
337 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.019928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.56 
 
 
314 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32 
 
 
319 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
315 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  34.06 
 
 
315 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
315 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127042  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1913  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
315 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.8749 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
315 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
315 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1935  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
337 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351672  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
315 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
315 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.62 
 
 
316 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
315 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
315 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1919  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
315 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3130  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.19 
 
 
324 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.56 
 
 
312 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.43 
 
 
314 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.89 
 
 
315 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.49 
 
 
315 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.99 
 
 
312 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.55 
 
 
314 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
315 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
315 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
311 aa  142  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
315 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  31.33 
 
 
319 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.83 
 
 
315 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.43 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.78 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3463  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.06 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281933  normal  0.770216 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.72 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0430198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.99 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.33 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.53 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.99 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.19 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000010971  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3689  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.82 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00564575  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.29 
 
 
313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.33 
 
 
324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.59 
 
 
331 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.82 
 
 
315 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.82 
 
 
315 aa  139  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.08 
 
 
327 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.97 
 
 
316 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.97 
 
 
316 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.46 
 
 
323 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.35 
 
 
320 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4123  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.25 
 
 
310 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0241029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.99 
 
 
313 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.33 
 
 
325 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0614  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.81 
 
 
314 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.35 
 
 
320 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  31.38 
 
 
327 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.09 
 
 
315 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.97 
 
 
315 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.99 
 
 
318 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
315 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.42 
 
 
316 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.99 
 
 
318 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.99 
 
 
320 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.99 
 
 
318 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.99 
 
 
318 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>