More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0582 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0582  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
313 aa  644    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0421  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.75 
 
 
314 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2923  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.43 
 
 
313 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.41 
 
 
315 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.34 
 
 
313 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.89 
 
 
308 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.35 
 
 
314 aa  395  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.773652  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.09 
 
 
313 aa  385  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185149  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.33 
 
 
313 aa  359  3e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.24 
 
 
309 aa  353  2e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.58 
 
 
309 aa  347  1e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.89 
 
 
309 aa  347  1e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.72 
 
 
309 aa  347  1e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.58 
 
 
309 aa  346  3e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.58 
 
 
309 aa  346  3e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.39 
 
 
309 aa  345  4e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.72 
 
 
309 aa  342  2.9999999999999997e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.88 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.88 
 
 
311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.58 
 
 
308 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
323 aa  323  3e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.22 
 
 
323 aa  322  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.22 
 
 
327 aa  321  8e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.57 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
317 aa  318  7e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.72 
 
 
331 aa  318  7e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
325 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.25 
 
 
317 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.3 
 
 
313 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.25 
 
 
327 aa  316  3e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.6 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.6 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.6 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.6 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.6 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.6 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.6 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.6 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.75 
 
 
322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.6 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.6 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.95 
 
 
315 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.42 
 
 
359 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
317 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
315 aa  306  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.3 
 
 
329 aa  306  3e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.57 
 
 
315 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.12 
 
 
310 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.44 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.44 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
318 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.12 
 
 
313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.51 
 
 
316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.12 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
310 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
310 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
310 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00928462  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
310 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.27 
 
 
315 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.47 
 
 
316 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.47 
 
 
316 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.47 
 
 
316 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
323 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
318 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
318 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
318 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
318 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.47 
 
 
318 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
315 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
318 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
318 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
318 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
314 aa  300  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
315 aa  299  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
315 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.14 
 
 
317 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.75 
 
 
316 aa  298  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.27 
 
 
313 aa  298  6e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.47 
 
 
320 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.47 
 
 
318 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.19 
 
 
311 aa  297  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0289  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.81 
 
 
317 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.47 
 
 
320 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.96 
 
 
315 aa  298  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.47 
 
 
320 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.14 
 
 
318 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.47 
 
 
318 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
310 aa  297  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
315 aa  296  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.14 
 
 
318 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
315 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.14 
 
 
320 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.14 
 
 
320 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
315 aa  295  7e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  50.32 
 
 
315 aa  295  7e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.8 
 
 
315 aa  295  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>