More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1817 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
314 aa  654    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.773652  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  79.87 
 
 
313 aa  531  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  75.88 
 
 
313 aa  495  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185149  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0582  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.35 
 
 
313 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0421  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.84 
 
 
314 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2923  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.53 
 
 
313 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.21 
 
 
308 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.98129  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.61 
 
 
315 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.17 
 
 
313 aa  367  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.13 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.62 
 
 
309 aa  335  3.9999999999999995e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.44 
 
 
309 aa  334  1e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.11 
 
 
309 aa  333  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.11 
 
 
309 aa  333  2e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.93 
 
 
309 aa  333  2e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.11 
 
 
309 aa  333  3e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.1 
 
 
309 aa  330  1e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.08 
 
 
309 aa  331  1e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.95 
 
 
317 aa  329  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.42 
 
 
311 aa  328  8e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.44 
 
 
323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.1 
 
 
331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.44 
 
 
327 aa  324  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.96 
 
 
308 aa  322  7e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.11 
 
 
323 aa  320  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.77 
 
 
323 aa  320  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.44 
 
 
327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.47 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.12 
 
 
318 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.79 
 
 
320 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.47 
 
 
320 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.14 
 
 
318 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
318 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
323 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
318 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
318 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
318 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
318 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.47 
 
 
318 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.47 
 
 
320 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
318 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.79 
 
 
320 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.79 
 
 
318 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.79 
 
 
320 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.79 
 
 
320 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.14 
 
 
318 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.81 
 
 
317 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  48.39 
 
 
321 aa  308  8e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.81 
 
 
316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  50.32 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.69 
 
 
325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
316 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
316 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  49.36 
 
 
319 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0289  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.48 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.81 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.96 
 
 
321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
324 aa  302  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
316 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
324 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
314 aa  302  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.72 
 
 
315 aa  301  9e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 
314 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
321 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.59 
 
 
316 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
319 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
316 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
321 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.72 
 
 
315 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.44 
 
 
321 aa  300  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.69 
 
 
313 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.57 
 
 
314 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
317 aa  299  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
325 aa  299  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 
315 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
359 aa  298  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
329 aa  298  7e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.19 
 
 
311 aa  298  8e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.72 
 
 
315 aa  298  9e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.4 
 
 
315 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.4 
 
 
315 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
313 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 
315 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 
315 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 
315 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1913  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 
315 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.8749 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 
315 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1919  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 
315 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2440  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 
337 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.019928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 
315 aa  296  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 
315 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.08 
 
 
315 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 
315 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 
315 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.35 
 
 
315 aa  296  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>