More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1506 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1506  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  100 
 
 
299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2689  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  70.9 
 
 
299 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0190  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  56.12 
 
 
305 aa  332  4e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1193  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  56.1 
 
 
301 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1710  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  52.16 
 
 
301 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5324  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  52.16 
 
 
301 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2358  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  48.76 
 
 
303 aa  298  6e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3877  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  51.79 
 
 
326 aa  291  7e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2472  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  49.66 
 
 
299 aa  287  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4512  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50.52 
 
 
313 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0398112  normal  0.511989 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4380  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  50.52 
 
 
313 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975377  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3458  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  49.31 
 
 
298 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.021419  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0202  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  47.95 
 
 
320 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1899  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  37.5 
 
 
306 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2240  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  41.54 
 
 
301 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3540  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  39.38 
 
 
299 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1716  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  39.13 
 
 
289 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4626  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  37.55 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3582  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.99 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2496  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  39.86 
 
 
305 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000223709 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1442  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  38.21 
 
 
304 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0541473  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0386  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.77 
 
 
275 aa  152  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1790  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.44 
 
 
290 aa  144  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1228  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.01 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1398  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.06 
 
 
287 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0500  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.66 
 
 
287 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1408  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.66 
 
 
287 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.58 
 
 
294 aa  123  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0660085  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1774  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.46 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.7 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.683749 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0204  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.3 
 
 
282 aa  116  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.37319  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2695  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.16 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905023  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1347  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.17 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0988459 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0167  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.42 
 
 
293 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00051892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.66 
 
 
291 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1877  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.57 
 
 
282 aa  105  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000092442  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0380  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.07 
 
 
285 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.447265  normal  0.0607873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1127  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.6 
 
 
297 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0087  ribose-phosphate pyrophosphokinase  29.86 
 
 
284 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0775  hypothetical protein  28.27 
 
 
281 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00000000110897  hitchhiker  0.00000000000484536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2392  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.27 
 
 
281 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0363  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.12 
 
 
283 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0975  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.06 
 
 
279 aa  99.4  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221596  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1747  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.34 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.400823  normal  0.232967 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.68 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0430198 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0317  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.33 
 
 
276 aa  95.9  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.300322  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.18 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.62 
 
 
322 aa  92.8  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.86 
 
 
331 aa  92.8  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.31 
 
 
331 aa  92.8  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  28.28 
 
 
312 aa  92.4  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.91 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.65 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.52 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.37 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.1 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0275  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.85 
 
 
285 aa  90.1  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000000178849  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.1 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0764  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.1 
 
 
361 aa  89.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.5 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.01 
 
 
309 aa  89.7  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.28 
 
 
325 aa  89.7  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.3 
 
 
325 aa  89.7  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.42 
 
 
315 aa  89.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0816  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.78 
 
 
305 aa  89.4  8e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1919  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.87 
 
 
315 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.87 
 
 
315 aa  89  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.87 
 
 
315 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.87 
 
 
315 aa  89  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.87 
 
 
315 aa  89  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1913  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.87 
 
 
315 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.8749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.87 
 
 
315 aa  89  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.87 
 
 
315 aa  89  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.87 
 
 
315 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3962  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.88 
 
 
324 aa  89  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.87 
 
 
315 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  26.87 
 
 
315 aa  89  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2440  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.87 
 
 
337 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.019928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1935  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.87 
 
 
337 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351672  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0101  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  27.08 
 
 
330 aa  89  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630999  hitchhiker  0.000002029 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0609  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.81 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.64 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4122  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.53 
 
 
311 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0525218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.45 
 
 
326 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.49 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.52 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.82 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.51 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0183  ribose-phosphate pyrophosphokinase  27.72 
 
 
331 aa  87  3e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.64 
 
 
324 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  25.28 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  23.39 
 
 
309 aa  86.3  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.94 
 
 
317 aa  85.9  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.16 
 
 
314 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0607  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.43 
 
 
315 aa  85.5  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.94 
 
 
315 aa  85.5  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  26.16 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1544  ribose-phosphate pyrophosphokinase  28.01 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0588  ribose-phosphate pyrophosphokinase  24.43 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>