More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0816 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0816  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
305 aa  617  1e-176  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0036  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.2 
 
 
308 aa  218  7e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.222395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.75 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.4 
 
 
332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.27 
 
 
310 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.56 
 
 
314 aa  208  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.4 
 
 
314 aa  208  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.4 
 
 
311 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.61 
 
 
311 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1625  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.02 
 
 
321 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.765759  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.74 
 
 
316 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.93 
 
 
310 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.74 
 
 
316 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.02 
 
 
321 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.41 
 
 
317 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.47 
 
 
320 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.2 
 
 
323 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.4 
 
 
325 aa  205  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.74 
 
 
314 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.26 
 
 
310 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.26 
 
 
310 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1089  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.12 
 
 
326 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.89 
 
 
310 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.93 
 
 
328 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.87 
 
 
318 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.26 
 
 
316 aa  203  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  40.86 
 
 
321 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.87 
 
 
318 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.54 
 
 
320 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.54 
 
 
320 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.54 
 
 
320 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.59 
 
 
310 aa  202  5e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.87 
 
 
318 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.81 
 
 
320 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.89 
 
 
320 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.91 
 
 
310 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0289  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.73 
 
 
317 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.89 
 
 
320 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.87 
 
 
318 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.87 
 
 
318 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.87 
 
 
318 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.87 
 
 
318 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.87 
 
 
318 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.87 
 
 
318 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.81 
 
 
318 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.87 
 
 
318 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.26 
 
 
310 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.98 
 
 
321 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.89 
 
 
310 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  40.98 
 
 
321 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.26 
 
 
311 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.51 
 
 
327 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.47 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.54 
 
 
316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0315  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.94 
 
 
318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515679  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.42 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.38 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.43 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0671  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.92 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.92 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.4 
 
 
317 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.4 
 
 
324 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40 
 
 
317 aa  196  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3730  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.19 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.322716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40 
 
 
331 aa  195  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.09 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.09 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.88 
 
 
317 aa  195  8.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.13 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.27 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.79 
 
 
309 aa  195  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.67 
 
 
316 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.75 
 
 
315 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.09 
 
 
315 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0172  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.83 
 
 
315 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.27 
 
 
315 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.4 
 
 
324 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.09 
 
 
315 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.09 
 
 
315 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.82 
 
 
319 aa  193  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2105  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.34 
 
 
318 aa  193  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537624  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.83 
 
 
315 aa  193  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2567  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.08 
 
 
315 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.39 
 
 
319 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.06 
 
 
319 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.42 
 
 
314 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.04 
 
 
312 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.4 
 
 
317 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.8 
 
 
314 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.74 
 
 
319 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.09 
 
 
315 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  39.27 
 
 
315 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  40 
 
 
319 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.27 
 
 
315 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.27 
 
 
315 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.08 
 
 
315 aa  192  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.27 
 
 
315 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1913  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.27 
 
 
315 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.8749 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.27 
 
 
315 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.27 
 
 
315 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>