More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0671 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0671  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
312 aa  629  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0971  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.72 
 
 
311 aa  464  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.4 
 
 
311 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.79 
 
 
310 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.51 
 
 
310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.19 
 
 
310 aa  444  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.87 
 
 
328 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.79 
 
 
310 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.79 
 
 
310 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.83 
 
 
317 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.51 
 
 
310 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0759  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.83 
 
 
310 aa  438  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.91 
 
 
310 aa  434  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.23 
 
 
310 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.23 
 
 
310 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.87 
 
 
310 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2438  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.08 
 
 
311 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167005  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.45 
 
 
314 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.13 
 
 
316 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.76 
 
 
311 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.91 
 
 
317 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.95 
 
 
314 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.59 
 
 
317 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.27 
 
 
317 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.17 
 
 
314 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.63 
 
 
310 aa  424  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.85 
 
 
346 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.85 
 
 
314 aa  420  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.59 
 
 
331 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.91 
 
 
317 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.31 
 
 
317 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384244  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.63 
 
 
317 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.38 
 
 
310 aa  408  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.14 
 
 
310 aa  391  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1089  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.86 
 
 
326 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2199  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.01 
 
 
339 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3823  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.82 
 
 
339 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2301  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  60.69 
 
 
339 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0976  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.69 
 
 
339 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508643  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.7 
 
 
315 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  61.74 
 
 
312 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.75 
 
 
342 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.7 
 
 
315 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.29 
 
 
318 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697734  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60 
 
 
311 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
315 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2931  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.81 
 
 
340 aa  363  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134005  normal  0.0220495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.81 
 
 
340 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.94 
 
 
316 aa  362  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0172  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
315 aa  361  1e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093989 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
315 aa  360  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.97 
 
 
313 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.79 
 
 
316 aa  359  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.68 
 
 
336 aa  358  6e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.87 
 
 
318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.01 
 
 
312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.33 
 
 
313 aa  356  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.65 
 
 
310 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0283  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.01 
 
 
318 aa  355  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.35 
 
 
311 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.77 
 
 
314 aa  353  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.45 
 
 
315 aa  352  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.73 
 
 
311 aa  352  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
315 aa  352  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
315 aa  352  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.65 
 
 
318 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.65 
 
 
318 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.65 
 
 
318 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.65 
 
 
318 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.65 
 
 
318 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.65 
 
 
318 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.65 
 
 
318 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.37 
 
 
313 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0607  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 
315 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0588  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.05 
 
 
315 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.79 
 
 
320 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.79 
 
 
320 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.65 
 
 
318 aa  349  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
332 aa  349  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2440  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
337 aa  349  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.019928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  349  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.37 
 
 
313 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  349  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1935  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
337 aa  349  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351672  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  349  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  56.55 
 
 
315 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1919  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1913  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.8749 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  349  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2105  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.37 
 
 
318 aa  348  5e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537624  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.37 
 
 
318 aa  348  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.97 
 
 
316 aa  348  6e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.37 
 
 
310 aa  348  6e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00928462  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.47 
 
 
320 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.23 
 
 
315 aa  348  8e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127042  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.55 
 
 
315 aa  348  9e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>