More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0965 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0965  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
315 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.365189  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  95.56 
 
 
315 aa  621  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1964  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.54 
 
 
314 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0451  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.1 
 
 
338 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.41 
 
 
316 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0435  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.77 
 
 
324 aa  296  3e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.187137  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.51 
 
 
317 aa  295  9e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.66 
 
 
324 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.51 
 
 
315 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.36 
 
 
314 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.35 
 
 
316 aa  292  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_377  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.34 
 
 
324 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.03 
 
 
316 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.12 
 
 
314 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
316 aa  285  8e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.13 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.44 
 
 
314 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.88 
 
 
325 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.63 
 
 
359 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.1 
 
 
308 aa  278  1e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.16 
 
 
310 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.45 
 
 
312 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.11 
 
 
317 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.83 
 
 
313 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.69 
 
 
321 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.05 
 
 
313 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2735  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.6 
 
 
308 aa  276  5e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.42 
 
 
309 aa  275  6e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.41 
 
 
318 aa  275  9e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2621  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.55 
 
 
324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.065708  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.84 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.63 
 
 
316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.45 
 
 
310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  45.02 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.09 
 
 
322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.45 
 
 
310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.86 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1558  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.51 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.16 
 
 
310 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.19 
 
 
314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.16 
 
 
317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.48 
 
 
310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.28 
 
 
309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.13 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.48 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.13 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.45 
 
 
314 aa  272  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.16 
 
 
310 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.66 
 
 
309 aa  271  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.12 
 
 
309 aa  271  1e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4537  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.3 
 
 
327 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0839  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.98 
 
 
317 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.16 
 
 
328 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.81 
 
 
316 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.16 
 
 
310 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.78 
 
 
312 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.84 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  45.6 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.16 
 
 
331 aa  269  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4145  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.23 
 
 
317 aa  269  5e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.41 
 
 
316 aa  269  5e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.9 
 
 
315 aa  268  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.9 
 
 
315 aa  268  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0778  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.4 
 
 
332 aa  268  8e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.75 
 
 
312 aa  268  8.999999999999999e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.79 
 
 
309 aa  268  8.999999999999999e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.75 
 
 
317 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.05 
 
 
321 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.05 
 
 
321 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.46 
 
 
309 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.87 
 
 
310 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0759  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.45 
 
 
310 aa  267  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.93 
 
 
327 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.79 
 
 
309 aa  267  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.63 
 
 
318 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.63 
 
 
318 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.63 
 
 
318 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.67 
 
 
327 aa  267  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.05 
 
 
321 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.45 
 
 
314 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.95 
 
 
318 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.63 
 
 
318 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.63 
 
 
318 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.63 
 
 
318 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.63 
 
 
318 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0673  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.19 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000671501  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.45 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.69 
 
 
311 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.31 
 
 
320 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.81 
 
 
331 aa  266  4e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.31 
 
 
320 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.31 
 
 
320 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.95 
 
 
318 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.45 
 
 
346 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.31 
 
 
320 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.48 
 
 
316 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.31 
 
 
320 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.48 
 
 
311 aa  265  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.49 
 
 
317 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.23 
 
 
324 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>