More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_4059 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_4059  predicted protein  100 
 
 
312 aa  638    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.94 
 
 
317 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32326  predicted protein  41.16 
 
 
309 aa  217  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.24 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.32 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40 
 
 
317 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40 
 
 
317 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384244  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.38 
 
 
312 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.69 
 
 
317 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.5 
 
 
314 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.69 
 
 
314 aa  205  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.99 
 
 
312 aa  205  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.62 
 
 
316 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.83 
 
 
321 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  35.83 
 
 
321 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.06 
 
 
317 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.44 
 
 
310 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.44 
 
 
310 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.6 
 
 
324 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.84 
 
 
325 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.3 
 
 
308 aa  202  6e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.87 
 
 
314 aa  202  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.38 
 
 
311 aa  201  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.42 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.07 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.88 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.75 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.32 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.87 
 
 
316 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.38 
 
 
309 aa  200  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  35.6 
 
 
319 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.56 
 
 
314 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.18 
 
 
319 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.53 
 
 
323 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0283  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.94 
 
 
318 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.88 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.56 
 
 
346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.07 
 
 
315 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.07 
 
 
315 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.75 
 
 
331 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.2 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2105  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.76 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537624  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.44 
 
 
317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.62 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.4 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.77 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.76 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.56 
 
 
310 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.56 
 
 
328 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.44 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.83 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.45 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.14 
 
 
318 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0971  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.81 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.5 
 
 
315 aa  196  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.51 
 
 
318 aa  196  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.14 
 
 
311 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  36.02 
 
 
321 aa  195  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.76 
 
 
311 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.25 
 
 
310 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.91 
 
 
309 aa  195  8.000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.45 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.45 
 
 
320 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.45 
 
 
320 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.45 
 
 
320 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.45 
 
 
320 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.22 
 
 
318 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.22 
 
 
318 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.22 
 
 
318 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.22 
 
 
318 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.22 
 
 
318 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.22 
 
 
318 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.22 
 
 
318 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.14 
 
 
314 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.88 
 
 
310 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.51 
 
 
313 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.45 
 
 
310 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.51 
 
 
310 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.51 
 
 
310 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.51 
 
 
310 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.2 
 
 
313 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.73 
 
 
315 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  37.77 
 
 
313 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.94 
 
 
318 aa  193  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.71 
 
 
319 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.14 
 
 
332 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3689  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.45 
 
 
324 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00564575  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.5 
 
 
315 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0172  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.27 
 
 
315 aa  193  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093989 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.42 
 
 
316 aa  192  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.96 
 
 
336 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.27 
 
 
315 aa  192  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.04 
 
 
315 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.27 
 
 
315 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.65 
 
 
314 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.94 
 
 
310 aa  192  5e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0759  ribose-phosphate pyrophosphokinase  37.27 
 
 
310 aa  192  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.89 
 
 
310 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00928462  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.14 
 
 
320 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  37.27 
 
 
315 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>