More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4249 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4628  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
326 aa  671    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.38327  normal  0.568111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4249  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
326 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4335  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
326 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  92.33 
 
 
326 aa  622  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1943  ribose-phosphate pyrophosphokinase  90.8 
 
 
326 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.985471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11035  ribose-phosphate pyrophosphokinase  85.89 
 
 
326 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3195  ribose-phosphate pyrophosphokinase  79.32 
 
 
325 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1545  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.4 
 
 
325 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.317921  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.07 
 
 
326 aa  478  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0656  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.38 
 
 
323 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.21 
 
 
324 aa  475  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0881  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.69 
 
 
327 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.328682 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1288  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.66 
 
 
326 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0987  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.78 
 
 
326 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  70.98 
 
 
326 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30170  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.06 
 
 
327 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.35865  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.09 
 
 
326 aa  455  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  68.75 
 
 
327 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.19 
 
 
326 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03490  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.56 
 
 
334 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.489296  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1290  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.05 
 
 
326 aa  444  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0909  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.24 
 
 
347 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.74 
 
 
326 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0789  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.43 
 
 
326 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.95 
 
 
324 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2708  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.62 
 
 
327 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13390  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.83 
 
 
326 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.271989  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3962  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.73 
 
 
324 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  64.76 
 
 
325 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.26 
 
 
325 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0169  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.95 
 
 
326 aa  414  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.09 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1015  ribose-phosphate diphosphokinase  62.97 
 
 
344 aa  410  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.04 
 
 
325 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.89 
 
 
325 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.17 
 
 
322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.17 
 
 
322 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0717  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.69 
 
 
316 aa  396  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.156805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.46 
 
 
337 aa  380  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1175  ribose-phosphate diphosphokinase  54.31 
 
 
337 aa  370  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
323 aa  350  3e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.6 
 
 
338 aa  296  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.23 
 
 
319 aa  295  6e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.23 
 
 
316 aa  295  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.23 
 
 
319 aa  295  9e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 
337 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.07 
 
 
338 aa  294  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.26 
 
 
331 aa  292  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
331 aa  291  9e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.9 
 
 
331 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.72 
 
 
330 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.99 
 
 
321 aa  290  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.39 
 
 
315 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.21 
 
 
317 aa  289  6e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.11 
 
 
330 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.32 
 
 
331 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.32 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.32 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.2 
 
 
317 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.2 
 
 
317 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.86 
 
 
325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.2 
 
 
317 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.2 
 
 
317 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.2 
 
 
317 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.2 
 
 
317 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.2 
 
 
317 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.2 
 
 
317 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.2 
 
 
317 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.2 
 
 
317 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.2 
 
 
317 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03970  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.38 
 
 
321 aa  281  1e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.579813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.4 
 
 
322 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.64 
 
 
315 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.64 
 
 
315 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.15 
 
 
331 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.15 
 
 
316 aa  279  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.66 
 
 
314 aa  279  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.15 
 
 
331 aa  278  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.08 
 
 
315 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  44.94 
 
 
317 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.46 
 
 
340 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0702588  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.08 
 
 
315 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  48.41 
 
 
312 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.83 
 
 
331 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.319247  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
311 aa  275  9e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.59 
 
 
319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.18 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.51 
 
 
331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.11 
 
 
325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.6 
 
 
322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.69 
 
 
319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.52 
 
 
313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.54 
 
 
314 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 
330 aa  273  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.79 
 
 
331 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.79 
 
 
316 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4145  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.13 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 
313 aa  269  5e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0759  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.33 
 
 
310 aa  269  5e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.462965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>