More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3471 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  81.86 
 
 		 202 aa  329  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1806  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  65.69 
 
 		 203 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0089  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  53.14 
 
 		 205 aa  214  5e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0798  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  43.93 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2276  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  40.38 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0772  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  43.96 
 
 		 198 aa  166  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00698153  hitchhiker  0.000000112154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2583  phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2261  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  41.51 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0519341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0705  phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 		 225 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4086  phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.288574  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2394  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  43.41 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.421061 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0272  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  41.83 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1417  phosphoribosyltransferase  37.19 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0973  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  42.51 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.405367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2698  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  40.28 
 
 		 206 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1599  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.15 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1077  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.64 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0870  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.15 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.200456  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1091  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1299  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.5 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  34.23 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  33.33 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0234  orotate phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1618  orotate phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  34.95 
 
 		 499 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0228  orotate phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0004  amidophosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 485 aa  53.9  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.970099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  33.98 
 
 		 500 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.42 
 
 		 316 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0340  orotate phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0150  orotate phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0289  orotate phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.42 
 
 		 316 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0035  orotate phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0041  orotate phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0278  orotate phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 		 227 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  35.35 
 
 		 500 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.38 
 
 		 316 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1976  amidophosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 511 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399256  normal  0.224002 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2299  amidophosphoribosyltransferase  30.36 
 
 		 508 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725008  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00031  amidophosphoribosyltransferase  29.46 
 
 		 486 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.486133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2460  amidophosphoribosyltransferase  30.97 
 
 		 510 aa  51.6  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0352966  normal  0.628087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0778  amidophosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 512 aa  51.6  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000128601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  34.34 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  26.4 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0071  orotate phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0139  orotate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 491 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0195  orotate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00031  amidophosphoribosyltransferase  29.46 
 
 		 486 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2130  amidophosphoribosyltransferase  27.03 
 
 		 511 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2034  orotate phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  26.4 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 491 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1806  amidophosphoribosyltransferase  27.03 
 
 		 511 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.704264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  36.08 
 
 		 311 aa  50.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  36.27 
 
 		 497 aa  50.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1714  amidophosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 511 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  26.46 
 
 		 474 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0122  orotate phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0536  amidophosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 511 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0004  amidophosphoribosyltransferase  29.46 
 
 		 486 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259611  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  33.02 
 
 		 488 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1289  orotate phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  32.85 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 491 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1865  amidophosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 511 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  26.74 
 
 		 493 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1264  orotate phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1656  amidophosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 511 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>