202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0089 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0089  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 
205 aa  413  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  53.14 
 
 
204 aa  214  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  51.96 
 
 
202 aa  206  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1806  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  45.59 
 
 
203 aa  190  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2394  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  45.1 
 
 
201 aa  167  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.421061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2583  phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0772  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  41.87 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00698153  hitchhiker  0.000000112154 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2276  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  39.9 
 
 
205 aa  161  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0705  phosphoribosyltransferase  40.44 
 
 
225 aa  160  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2261  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  41.04 
 
 
212 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0519341  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2698  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  42.38 
 
 
206 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0272  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  40.48 
 
 
204 aa  155  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0798  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  41.04 
 
 
211 aa  153  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0973  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  42.16 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.405367  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4086  phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.288574  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1417  phosphoribosyltransferase  35.35 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1091  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  36.14 
 
 
205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1599  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.5 
 
 
205 aa  118  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1077  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.99 
 
 
205 aa  118  7e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0870  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.5 
 
 
205 aa  117  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.200456  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1299  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.64 
 
 
206 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
191 aa  56.6  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 
193 aa  55.1  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1053  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.295843  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  24.71 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2427  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  26.89 
 
 
192 aa  52  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  27.41 
 
 
199 aa  51.6  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  28.7 
 
 
187 aa  51.6  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  28.7 
 
 
187 aa  51.6  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
233 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  25.95 
 
 
189 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1468  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 
179 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  24.03 
 
 
192 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  24.03 
 
 
192 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 
195 aa  48.5  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1302  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
226 aa  48.5  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal  0.0146938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2313  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
177 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3863  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
180 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.419035  normal  0.0674381 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0168  orotate phosphoribosyltransferase  27.73 
 
 
237 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05884  orotate phosphoribosyltransferase (Eurofung)  29.25 
 
 
241 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  32.67 
 
 
316 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0225  orotate phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.195509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1712  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  24.37 
 
 
173 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00363084  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  29.84 
 
 
172 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1351  Uracil phosphoribosyltransferase  29.84 
 
 
185 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00861073 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.25 
 
 
314 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1852  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  32.35 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.897304  normal  0.461813 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1895  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
177 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0521  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.878588  hitchhiker  0.00908812 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.29 
 
 
332 aa  45.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  35.35 
 
 
321 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.35 
 
 
321 aa  45.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  23.85 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2540  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  26.9 
 
 
180 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0611  phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 
178 aa  45.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0416162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4024  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
182 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
175 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1091  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  26.19 
 
 
180 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3362  phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
182 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.953649  hitchhiker  0.000470986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0234  orotate phosphoribosyltransferase  29.9 
 
 
236 aa  45.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960062  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.93 
 
 
310 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.56 
 
 
314 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2541  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.89 
 
 
181 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1879  Uracil phosphoribosyltransferase  28.23 
 
 
179 aa  45.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.812651  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  24 
 
 
183 aa  45.1  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09350  Uracil phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
185 aa  45.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.724521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  30.56 
 
 
311 aa  45.1  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1364  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  26.05 
 
 
173 aa  45.1  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0131251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  33.67 
 
 
311 aa  44.7  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0071  Uracil phosphoribosyltransferase  25.78 
 
 
179 aa  44.7  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000243605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2181  orotate phosphoribosyltransferase  26.14 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134132  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.68 
 
 
316 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0216  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3093  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.73 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2103  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  29.92 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1817  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  29.92 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.655937  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34 
 
 
315 aa  44.3  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0340  orotate phosphoribosyltransferase  30.09 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3762  phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
169 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  35.29 
 
 
321 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  29.71 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>