More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0023 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0023  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00393898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1212  phosphoribosyltransferase  58.22 
 
 		 246 aa  261  8e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.279163  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1267  adenine phosphoribosyltransferase  36.4 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1854  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.787643 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2104  adenine phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.52752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0200  adenine phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0563  adenine phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0138344 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1785  adenine phosphoribosyltransferase  28.71 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0254  adenine phosphoribosyltransferase  27.8 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2790  phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0958  phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.934235  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1102  phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 		 250 aa  85.9  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 202 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  30.68 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0134  pur operon repressor  27.45 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000199065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  32 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0040  pur operon repressor  29.45 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0530  pur operon repressor  26.16 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0517  pur operon repressor  26.16 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00109684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  25.47 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1608  pur operon repressor  26.07 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3789  adenine phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 182 aa  62  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  29.48 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44500  adenine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 182 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.772947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 		 182 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  25.9 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1772  pur operon repressor  25.17 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1417  phosphoribosyltransferase  35.88 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  29.08 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  25.95 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  26.51 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0333  adenine phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1005  adenine phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.233001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  23.81 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0772  adenine phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0604  adenine phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 197 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1765  pur operon repressor  24.7 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.011589  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0887  adenine phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4266  adenine phosphoribosyltransferase  28.24 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1602  adenine phosphoribosyltransferase  28.24 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143258 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  25.6 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3584  adenine phosphoribosyltransferase  28.24 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3831  adenine phosphoribosyltransferase  28.24 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.660838 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  29.66 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0934  adenine phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  25.6 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>