More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0836 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
175 aa  350  7e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  54.86 
 
 
181 aa  204  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 
172 aa  179  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
182 aa  178  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  49.71 
 
 
173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
171 aa  167  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 
176 aa  167  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
214 aa  167  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 
172 aa  164  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
168 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
170 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
173 aa  164  8e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
171 aa  163  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 
171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  47.16 
 
 
178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
172 aa  160  6e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  45.71 
 
 
178 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
181 aa  160  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 
177 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 
173 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
180 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
182 aa  159  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  49.07 
 
 
174 aa  158  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
170 aa  157  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  44 
 
 
178 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
172 aa  157  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
181 aa  157  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
181 aa  157  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
170 aa  157  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
182 aa  156  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
178 aa  156  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
180 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
184 aa  156  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
179 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
172 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
172 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
175 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
181 aa  155  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
171 aa  155  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
170 aa  155  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
174 aa  155  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
197 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
181 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  46.82 
 
 
181 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  46.82 
 
 
181 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
198 aa  154  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
187 aa  154  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  154  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  48.75 
 
 
170 aa  154  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
173 aa  154  7e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
181 aa  154  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  154  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
187 aa  154  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
181 aa  154  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1044  adenine phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
182 aa  153  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  153  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  153  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  153  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  153  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  153  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  48.55 
 
 
183 aa  153  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  153  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
173 aa  153  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 
178 aa  153  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
196 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
188 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  47.43 
 
 
173 aa  152  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
179 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
175 aa  152  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 
179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
172 aa  151  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
185 aa  151  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
188 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
193 aa  151  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
188 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  50.64 
 
 
172 aa  151  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
171 aa  151  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
182 aa  151  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
185 aa  151  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
188 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  44.77 
 
 
424 aa  150  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 
179 aa  150  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  45.35 
 
 
181 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
173 aa  150  8.999999999999999e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 
170 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
179 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
183 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
181 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
187 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
178 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
185 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 
181 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
181 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>