More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0813 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 177 aa  353  6.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 		 175 aa  207  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  54.49 
 
 		 181 aa  200  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  53.41 
 
 		 214 aa  197  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  58.02 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  55.62 
 
 		 172 aa  192  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 		 181 aa  191  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  56.36 
 
 		 176 aa  190  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 		 180 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  52.73 
 
 		 181 aa  189  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  52.73 
 
 		 181 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  55.28 
 
 		 173 aa  189  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  52.73 
 
 		 181 aa  189  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  49.44 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  51.14 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 181 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  54.66 
 
 		 178 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 181 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 		 184 aa  187  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  54.66 
 
 		 178 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  54.49 
 
 		 183 aa  185  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  55.97 
 
 		 175 aa  185  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  53.89 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  56.97 
 
 		 175 aa  184  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  56.88 
 
 		 170 aa  184  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  53.46 
 
 		 182 aa  184  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  52.69 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  57.5 
 
 		 170 aa  182  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 		 171 aa  180  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  49.44 
 
 		 181 aa  181  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 		 171 aa  180  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 183 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 		 197 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  52.5 
 
 		 190 aa  177  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  50.9 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 		 181 aa  177  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  52.76 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  53.12 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1540  adenine phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1489  adenine phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  51.55 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  53.09 
 
 		 174 aa  174  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  52.8 
 
 		 171 aa  174  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  47.7 
 
 		 184 aa  174  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  56.41 
 
 		 424 aa  175  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  47.7 
 
 		 184 aa  175  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1626  adenine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 		 181 aa  174  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0996441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 		 172 aa  174  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  53.46 
 
 		 187 aa  174  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 		 172 aa  174  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 		 182 aa  174  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 		 171 aa  173  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  55 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>