More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0559 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  99.45 
 
 
183 aa  362  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  99.45 
 
 
183 aa  362  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  99.45 
 
 
183 aa  362  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  99.45 
 
 
183 aa  362  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  99.45 
 
 
183 aa  362  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  99.45 
 
 
183 aa  362  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  99.45 
 
 
183 aa  362  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  99.45 
 
 
183 aa  362  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  95.08 
 
 
183 aa  349  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  94.54 
 
 
183 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  94.54 
 
 
183 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  94.54 
 
 
183 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  94.54 
 
 
183 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  94.54 
 
 
183 aa  346  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  83.06 
 
 
182 aa  305  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  81.42 
 
 
182 aa  300  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  80.87 
 
 
198 aa  299  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  80.43 
 
 
185 aa  298  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  80.33 
 
 
185 aa  295  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  79.67 
 
 
187 aa  294  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  79.67 
 
 
187 aa  294  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  79.67 
 
 
187 aa  293  9e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  73.89 
 
 
181 aa  271  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  73.33 
 
 
181 aa  268  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  72.78 
 
 
181 aa  266  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  74.43 
 
 
197 aa  266  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  72.22 
 
 
181 aa  264  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  73.86 
 
 
181 aa  259  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  71.58 
 
 
183 aa  259  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  68.85 
 
 
185 aa  255  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  68.85 
 
 
183 aa  251  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  68.85 
 
 
183 aa  251  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  68.85 
 
 
183 aa  250  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  70.22 
 
 
181 aa  249  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  69.23 
 
 
184 aa  249  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  71.02 
 
 
181 aa  249  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  69.23 
 
 
184 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  69.23 
 
 
184 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  69.23 
 
 
184 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  69.23 
 
 
184 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  68.31 
 
 
184 aa  248  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  70.06 
 
 
182 aa  247  8e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  65.14 
 
 
178 aa  240  7.999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  65.9 
 
 
178 aa  235  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  64.74 
 
 
174 aa  235  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  63.39 
 
 
181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 
181 aa  228  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  56.42 
 
 
181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  55.87 
 
 
181 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  55.87 
 
 
181 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  53.63 
 
 
181 aa  206  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
181 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  54.49 
 
 
181 aa  201  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
181 aa  201  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
180 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  56.98 
 
 
175 aa  199  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 
181 aa  198  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  56.65 
 
 
175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
199 aa  195  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  53.45 
 
 
177 aa  194  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
180 aa  193  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 
179 aa  191  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  56.02 
 
 
170 aa  190  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
179 aa  190  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  51.14 
 
 
188 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  51.14 
 
 
188 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
186 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
188 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
184 aa  187  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
171 aa  187  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
179 aa  187  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
170 aa  187  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
177 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
171 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  49.19 
 
 
184 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  49.19 
 
 
184 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
205 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
179 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
178 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0935  adenine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 
175 aa  185  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
190 aa  185  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
172 aa  184  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
188 aa  184  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 
202 aa  184  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  52.73 
 
 
177 aa  184  6e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 
202 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  48.59 
 
 
194 aa  184  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
172 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
172 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
188 aa  183  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
188 aa  183  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  55.42 
 
 
172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0680  adenine phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>