More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0816 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
171 aa  342  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  76.61 
 
 
214 aa  271  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  55.29 
 
 
182 aa  185  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 
172 aa  184  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
424 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
177 aa  180  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
175 aa  180  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
173 aa  180  7e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 
172 aa  180  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 
181 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  57.69 
 
 
181 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 
179 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  56.47 
 
 
179 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 
181 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
181 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
181 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  50.89 
 
 
173 aa  177  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
171 aa  177  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
171 aa  176  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 
172 aa  176  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
170 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
170 aa  176  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
183 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
183 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
183 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 
172 aa  175  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  53.89 
 
 
183 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
183 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
174 aa  176  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
183 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
171 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
183 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 
179 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
171 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
172 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
172 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
183 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 
172 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 
182 aa  175  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
180 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
178 aa  174  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
178 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
181 aa  174  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
171 aa  174  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
176 aa  174  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
183 aa  174  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 
175 aa  174  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
180 aa  174  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 
181 aa  173  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 
187 aa  173  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  57.74 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
178 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
173 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  51.5 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
181 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 
176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
170 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
202 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
170 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
172 aa  170  6.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
172 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
173 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
172 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
202 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
172 aa  170  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  54.12 
 
 
174 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  54.78 
 
 
197 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 
179 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 
186 aa  169  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
199 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
185 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 
181 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
170 aa  168  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  56.69 
 
 
193 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
190 aa  168  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
178 aa  168  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
176 aa  168  3e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
173 aa  168  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
171 aa  168  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
185 aa  168  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
177 aa  168  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
182 aa  167  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
175 aa  167  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 
184 aa  167  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>