More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0311 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  92.63 
 
 		 205 aa  360  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  85.19 
 
 		 231 aa  329  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  85.11 
 
 		 202 aa  327  7e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  84.57 
 
 		 202 aa  325  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0603  adenine phosphoribosyltransferase  72.11 
 
 		 188 aa  291  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0244339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  78.77 
 
 		 184 aa  291  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  78.77 
 
 		 184 aa  290  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0333  adenine phosphoribosyltransferase  77.53 
 
 		 188 aa  290  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4115  adenine phosphoribosyltransferase  71.58 
 
 		 188 aa  286  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  78.21 
 
 		 184 aa  285  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  76.54 
 
 		 194 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  75.72 
 
 		 196 aa  276  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  68.95 
 
 		 188 aa  274  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  73.74 
 
 		 185 aa  273  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  71.91 
 
 		 216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0772  adenine phosphoribosyltransferase  71.35 
 
 		 187 aa  270  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0493  adenine phosphoribosyltransferase  70.22 
 
 		 188 aa  270  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0604  adenine phosphoribosyltransferase  71.35 
 
 		 197 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  69.66 
 
 		 188 aa  269  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  69.66 
 
 		 188 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  69.66 
 
 		 188 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  69.66 
 
 		 188 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  69.1 
 
 		 188 aa  267  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  69.1 
 
 		 188 aa  267  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  62.21 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  61.4 
 
 		 181 aa  234  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1521  adenine phosphoribosyltransferase  62.92 
 
 		 206 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.781785  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0069  adenine phosphoribosyltransferase  62.92 
 
 		 206 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 		 175 aa  202  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 181 aa  201  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 		 181 aa  198  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 		 181 aa  198  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44500  adenine phosphoribosyltransferase  54.12 
 
 		 182 aa  198  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.772947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 		 180 aa  198  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3789  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 182 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 		 187 aa  194  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 		 181 aa  194  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2232  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 		 180 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2616  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 182 aa  191  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0092322  normal  0.996002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 181 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 		 181 aa  190  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 181 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 		 181 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  49.47 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  46.74 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 		 184 aa  187  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1810  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 182 aa  187  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  48.59 
 
 		 181 aa  187  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  46.02 
 
 		 178 aa  185  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 183 aa  185  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3426  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 182 aa  184  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4266  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 182 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1602  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 182 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3584  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 182 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3831  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 182 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.660838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 183 aa  184  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 183 aa  184  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 183 aa  184  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 183 aa  184  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 183 aa  184  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 183 aa  184  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 183 aa  184  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  47.13 
 
 		 183 aa  184  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1990  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 		 182 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  45.66 
 
 		 181 aa  181  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 183 aa  181  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0935  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 175 aa  180  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 		 187 aa  180  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  44.63 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>