More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2232 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2232  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
180 aa  361  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2616  adenine phosphoribosyltransferase  55.37 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0092322  normal  0.996002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1810  adenine phosphoribosyltransferase  55.93 
 
 
182 aa  217  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3789  adenine phosphoribosyltransferase  55.37 
 
 
182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44500  adenine phosphoribosyltransferase  54.8 
 
 
182 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.772947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1990  adenine phosphoribosyltransferase  53.67 
 
 
182 aa  207  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3426  adenine phosphoribosyltransferase  53.67 
 
 
182 aa  204  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  54.34 
 
 
180 aa  200  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  51.72 
 
 
202 aa  198  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
205 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4266  adenine phosphoribosyltransferase  51.41 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3831  adenine phosphoribosyltransferase  51.41 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.660838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1602  adenine phosphoribosyltransferase  51.41 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.143258 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  51.14 
 
 
181 aa  194  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3584  adenine phosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
182 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
190 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  51.41 
 
 
196 aa  191  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0333  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
188 aa  191  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  51.14 
 
 
184 aa  190  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  51.14 
 
 
185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
184 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0603  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
188 aa  187  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0244339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 
194 aa  186  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4115  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 
188 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
184 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
188 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
188 aa  184  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
188 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
188 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0772  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
187 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0604  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
197 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0493  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
188 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
181 aa  174  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
179 aa  174  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  47.73 
 
 
179 aa  171  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
179 aa  167  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  45.66 
 
 
179 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  44.77 
 
 
178 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  44.77 
 
 
178 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
178 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  43.89 
 
 
179 aa  160  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
178 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 
177 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  43.89 
 
 
179 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
175 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 
177 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 
199 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
181 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
183 aa  157  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  44.89 
 
 
187 aa  156  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
186 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
181 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
173 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 
179 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
197 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  44.19 
 
 
175 aa  155  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
181 aa  154  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
183 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
183 aa  152  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
183 aa  152  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  45.4 
 
 
183 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
183 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
183 aa  152  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
180 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  42.2 
 
 
181 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
183 aa  152  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
183 aa  152  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2383  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106176  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
181 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
178 aa  151  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
184 aa  150  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 
183 aa  149  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
185 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
184 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0935  adenine phosphoribosyltransferase  46.82 
 
 
175 aa  149  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
181 aa  148  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 
183 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
182 aa  148  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
184 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
184 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
184 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
184 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1727  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
177 aa  147  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.190477  normal  0.0498652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
183 aa  147  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
183 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>