More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2146 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
186 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  85.63 
 
 
179 aa  306  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  77.59 
 
 
179 aa  286  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  79.31 
 
 
179 aa  285  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  76.11 
 
 
180 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  76.44 
 
 
181 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  77.59 
 
 
179 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  78.74 
 
 
181 aa  284  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  76.57 
 
 
181 aa  284  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  76.44 
 
 
181 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  75.29 
 
 
199 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  78.61 
 
 
181 aa  278  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  73.86 
 
 
180 aa  276  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  77.46 
 
 
181 aa  269  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  76.88 
 
 
181 aa  269  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  72.25 
 
 
181 aa  267  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  72.25 
 
 
181 aa  267  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  72.25 
 
 
181 aa  267  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  72.83 
 
 
181 aa  267  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3201  adenine phosphoribosyltransferase  82.17 
 
 
157 aa  261  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.706653  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1626  adenine phosphoribosyltransferase  72.57 
 
 
181 aa  254  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0996441  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1540  adenine phosphoribosyltransferase  73.26 
 
 
186 aa  251  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1489  adenine phosphoribosyltransferase  73.26 
 
 
181 aa  251  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  68.79 
 
 
175 aa  247  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  61.49 
 
 
175 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 
178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  59.3 
 
 
178 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 
178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  59.43 
 
 
179 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 
179 aa  208  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  57.07 
 
 
187 aa  205  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 
179 aa  204  6e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  52.54 
 
 
196 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
182 aa  194  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
180 aa  190  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
198 aa  190  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  53.14 
 
 
194 aa  190  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 
182 aa  189  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
188 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
183 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
185 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
183 aa  188  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
183 aa  188  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
183 aa  188  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
183 aa  188  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
183 aa  188  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
216 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
183 aa  188  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
183 aa  188  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
188 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  52.6 
 
 
183 aa  188  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
188 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0772  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
187 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 
177 aa  186  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0604  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
197 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
188 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  53.14 
 
 
177 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
184 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
178 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
188 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
188 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
188 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
181 aa  185  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
183 aa  185  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
184 aa  184  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
187 aa  184  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
187 aa  184  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
184 aa  184  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
185 aa  184  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
181 aa  184  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 
181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2383  adenine phosphoribosyltransferase  57.31 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106176  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 
168 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
178 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
181 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0603  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0244339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
183 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
181 aa  181  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4115  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
188 aa  181  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
183 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
183 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
183 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
183 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
183 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
183 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  51.4 
 
 
182 aa  180  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
183 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
181 aa  180  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
184 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
170 aa  179  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
184 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
205 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
197 aa  179  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
184 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
184 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
181 aa  179  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>