More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3812 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  79.78 
 
 		 184 aa  302  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  79.23 
 
 		 184 aa  300  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  82.29 
 
 		 184 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  80.57 
 
 		 194 aa  290  9e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  80.57 
 
 		 185 aa  289  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  76.88 
 
 		 205 aa  279  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  75.72 
 
 		 190 aa  276  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0333  adenine phosphoribosyltransferase  73.26 
 
 		 188 aa  274  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  75.14 
 
 		 231 aa  267  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  72.68 
 
 		 202 aa  266  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4115  adenine phosphoribosyltransferase  72.07 
 
 		 188 aa  266  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0603  adenine phosphoribosyltransferase  68.62 
 
 		 188 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0244339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  71.04 
 
 		 202 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  69.27 
 
 		 188 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0772  adenine phosphoribosyltransferase  70.95 
 
 		 187 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0604  adenine phosphoribosyltransferase  70.95 
 
 		 197 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  70.95 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  68.16 
 
 		 188 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  67.6 
 
 		 188 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  67.6 
 
 		 188 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  67.6 
 
 		 188 aa  255  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0493  adenine phosphoribosyltransferase  68.89 
 
 		 188 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  67.6 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  67.6 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  62.79 
 
 		 180 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  61.76 
 
 		 181 aa  229  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0069  adenine phosphoribosyltransferase  71.81 
 
 		 206 aa  217  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1521  adenine phosphoribosyltransferase  71.81 
 
 		 206 aa  217  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.781785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  57.46 
 
 		 181 aa  210  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  56.91 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  55.43 
 
 		 181 aa  205  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 		 181 aa  204  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 		 181 aa  204  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 		 179 aa  204  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 		 175 aa  204  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 181 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  54.34 
 
 		 181 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 181 aa  201  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 		 199 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2616  adenine phosphoribosyltransferase  53.45 
 
 		 182 aa  197  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0092322  normal  0.996002 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 179 aa  198  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  52.25 
 
 		 197 aa  197  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  53.93 
 
 		 178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 181 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  52.54 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 179 aa  194  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 175 aa  193  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44500  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.772947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3426  adenine phosphoribosyltransferase  53.45 
 
 		 182 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2232  adenine phosphoribosyltransferase  51.41 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  51.69 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3789  adenine phosphoribosyltransferase  51.72 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  53.14 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1990  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1810  adenine phosphoribosyltransferase  54.12 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  53.45 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 173 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  50.86 
 
 		 180 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  50.86 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 198 aa  188  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3584  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  48.9 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  48.9 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  49.14 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4266  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 182 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  46.03 
 
 		 187 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  48.9 
 
 		 183 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3831  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 182 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.660838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1602  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 182 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 		 181 aa  185  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 181 aa  185  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  47.43 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  48.9 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  47.7 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  47.51 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  48.59 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_004310  BR1540  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1489  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 181 aa  181  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 184 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 184 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 184 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 184 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 181 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  47.51 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  47.7 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  47.19 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1626  adenine phosphoribosyltransferase  50.86 
 
 		 181 aa  178  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0996441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>