More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2619 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 173 aa  345  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0935  adenine phosphoribosyltransferase  59.43 
 
 		 175 aa  202  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  55.29 
 
 		 181 aa  199  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 197 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  54.34 
 
 		 179 aa  197  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 		 178 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 		 178 aa  197  9e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 184 aa  192  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 173 aa  193  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 181 aa  191  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  54.12 
 
 		 172 aa  191  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 181 aa  191  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  52.3 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 184 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 184 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 184 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 184 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 181 aa  191  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 183 aa  190  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  52.3 
 
 		 199 aa  190  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 		 182 aa  189  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 181 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  51.72 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 		 174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 		 179 aa  187  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  51.72 
 
 		 179 aa  187  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 		 194 aa  187  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 171 aa  187  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 170 aa  187  9e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 181 aa  187  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 175 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 		 184 aa  185  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 		 170 aa  185  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 181 aa  184  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 		 181 aa  184  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 181 aa  183  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 		 181 aa  184  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  50.86 
 
 		 184 aa  183  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 		 186 aa  183  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 		 175 aa  183  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 		 180 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  54.9 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  50.86 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0333  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2383  adenine phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 		 176 aa  181  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 		 182 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  50.85 
 
 		 177 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 		 176 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 181 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 205 aa  181  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 		 187 aa  180  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  180  9.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 171 aa  179  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  49.15 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0493  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4115  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 		 183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 231 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 		 171 aa  178  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0603  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 188 aa  177  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0244339 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 		 174 aa  178  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 202 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>