More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13598 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  100 
 
 		 173 aa  349  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  66.07 
 
 		 170 aa  235  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  65.43 
 
 		 172 aa  214  4e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  55.28 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  56.65 
 
 		 171 aa  184  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 170 aa  184  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 180 aa  181  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  54.34 
 
 		 171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  54.34 
 
 		 171 aa  178  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 		 214 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 		 171 aa  177  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 		 171 aa  177  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 172 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 		 182 aa  174  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 171 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  51.41 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 		 174 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 170 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 		 184 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 		 174 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  51.53 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 173 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 171 aa  170  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 		 193 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 183 aa  167  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  47.53 
 
 		 181 aa  167  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 170 aa  167  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  47.53 
 
 		 181 aa  167  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  47.53 
 
 		 181 aa  167  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  51.83 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 181 aa  166  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  51.27 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  47.53 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  49.08 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 		 177 aa  164  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 		 181 aa  164  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 		 172 aa  164  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 174 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  49.39 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  51.27 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  47.24 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 		 173 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 		 180 aa  160  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 		 172 aa  160  7e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 		 199 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 		 178 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  47.24 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 		 178 aa  158  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 172 aa  158  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  44.79 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 172 aa  158  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 		 175 aa  158  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 		 179 aa  157  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 		 172 aa  157  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 		 183 aa  157  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>