More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1952 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  72.51 
 
 
171 aa  257  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  69.01 
 
 
175 aa  238  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  60.69 
 
 
172 aa  198  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  60.69 
 
 
172 aa  198  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  54.44 
 
 
174 aa  191  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  57.56 
 
 
172 aa  190  8e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  58.14 
 
 
172 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 
170 aa  188  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
172 aa  187  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
170 aa  188  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 
174 aa  187  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  54.34 
 
 
170 aa  186  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 
172 aa  184  6e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  56.47 
 
 
173 aa  184  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 
173 aa  183  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 
173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 
172 aa  180  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 
172 aa  180  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
170 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
172 aa  178  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 
170 aa  177  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
170 aa  176  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
175 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  53.14 
 
 
172 aa  175  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 
172 aa  175  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
170 aa  174  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
168 aa  174  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
170 aa  174  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
174 aa  173  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
173 aa  173  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
170 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
170 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
170 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
170 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
170 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
170 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 
177 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
170 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
183 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
187 aa  170  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
187 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
187 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 
424 aa  170  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
183 aa  169  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
183 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
183 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
183 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
178 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
172 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
183 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
183 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  51.16 
 
 
173 aa  169  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
183 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  50.87 
 
 
183 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  46.82 
 
 
175 aa  169  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
183 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 
173 aa  168  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
172 aa  168  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
172 aa  168  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
181 aa  168  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
181 aa  168  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
172 aa  168  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
181 aa  168  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
182 aa  167  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  49.08 
 
 
181 aa  167  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
175 aa  167  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
176 aa  167  8e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
176 aa  167  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
185 aa  167  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 
179 aa  167  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
172 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
197 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
179 aa  166  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
181 aa  166  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
178 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
185 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  52.17 
 
 
176 aa  166  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  49.08 
 
 
181 aa  164  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
182 aa  164  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
183 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
172 aa  164  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
183 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
183 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
181 aa  164  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
183 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
198 aa  164  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
181 aa  164  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
183 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>