More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0657 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
170 aa  343  5e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  78.82 
 
 
172 aa  280  8.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  77.06 
 
 
172 aa  279  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  67.65 
 
 
170 aa  238  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 
170 aa  233  7e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 
170 aa  231  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  63.53 
 
 
172 aa  229  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  63.53 
 
 
172 aa  229  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 
170 aa  227  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 
170 aa  227  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 
170 aa  227  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  66.47 
 
 
170 aa  227  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 
170 aa  227  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 
170 aa  227  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 
170 aa  227  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 
170 aa  226  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 
170 aa  226  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 
170 aa  226  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  62.35 
 
 
172 aa  224  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  56.9 
 
 
176 aa  207  8e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 
175 aa  204  4e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  58.24 
 
 
172 aa  202  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  58.24 
 
 
172 aa  202  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
175 aa  201  6e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  54.12 
 
 
170 aa  197  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
170 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
170 aa  191  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  51.5 
 
 
174 aa  188  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  55.41 
 
 
187 aa  185  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  55.41 
 
 
187 aa  185  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  55.41 
 
 
187 aa  185  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
172 aa  184  7e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  184  7e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
183 aa  179  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
183 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
183 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
183 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
183 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
183 aa  179  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
183 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
170 aa  179  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
183 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  54.14 
 
 
183 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  53.16 
 
 
181 aa  177  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  51.55 
 
 
173 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
173 aa  176  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
182 aa  176  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
175 aa  175  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  53.46 
 
 
197 aa  175  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 
183 aa  174  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 
183 aa  174  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  50.9 
 
 
181 aa  174  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
183 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
173 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 
181 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  52.47 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
180 aa  171  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
214 aa  171  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
181 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
174 aa  170  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
181 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
185 aa  170  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
198 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
184 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
183 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
183 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  51.5 
 
 
187 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
182 aa  168  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
183 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
171 aa  167  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
174 aa  167  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
185 aa  167  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
172 aa  167  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  51.55 
 
 
170 aa  167  9e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
171 aa  166  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
176 aa  165  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
181 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
181 aa  165  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  52.26 
 
 
179 aa  165  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
181 aa  164  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
172 aa  164  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  49.06 
 
 
175 aa  164  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
184 aa  163  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
172 aa  163  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>