More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0547 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
174 aa  347  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  60.95 
 
 
175 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  57.99 
 
 
171 aa  206  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  55.95 
 
 
172 aa  202  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  55.95 
 
 
172 aa  202  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
170 aa  195  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
170 aa  192  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
170 aa  192  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 
174 aa  192  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  54.44 
 
 
171 aa  191  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
176 aa  190  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
172 aa  189  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
170 aa  188  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
170 aa  187  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
176 aa  186  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
172 aa  186  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
172 aa  186  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
172 aa  184  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
172 aa  184  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
170 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
173 aa  182  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
179 aa  181  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  47.7 
 
 
179 aa  180  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
172 aa  180  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  180  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
170 aa  179  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
170 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
170 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
170 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
175 aa  177  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
178 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
170 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
170 aa  176  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
170 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
170 aa  176  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
170 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
170 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  52.47 
 
 
172 aa  176  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
172 aa  175  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
172 aa  175  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
170 aa  175  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
178 aa  175  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
172 aa  175  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
172 aa  175  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
181 aa  175  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
173 aa  174  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
176 aa  174  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
181 aa  174  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
181 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  47.16 
 
 
187 aa  174  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  47.16 
 
 
187 aa  174  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
181 aa  173  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  47.16 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  46.3 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
199 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  49.38 
 
 
175 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  49.11 
 
 
173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
172 aa  171  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
187 aa  171  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
176 aa  170  6.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  46.91 
 
 
179 aa  170  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
170 aa  170  7.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  46.3 
 
 
179 aa  169  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
424 aa  170  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 
181 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf610  adenine phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 
171 aa  169  2e-41  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.107606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
180 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  45.98 
 
 
177 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
184 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
173 aa  169  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
184 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
184 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
184 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
183 aa  168  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
181 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 
177 aa  168  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
214 aa  167  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
183 aa  167  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>