More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1198 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 172 aa  346  1e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  93.6 
 
 		 172 aa  328  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  93.6 
 
 		 172 aa  328  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  74.12 
 
 		 170 aa  269  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  75.29 
 
 		 170 aa  269  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  68.82 
 
 		 170 aa  246  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  68.24 
 
 		 170 aa  240  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  68.24 
 
 		 170 aa  240  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  68.24 
 
 		 170 aa  240  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  68.24 
 
 		 170 aa  240  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  68.24 
 
 		 170 aa  240  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  68.24 
 
 		 170 aa  240  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  68.24 
 
 		 170 aa  240  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  68.24 
 
 		 170 aa  240  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  68.24 
 
 		 170 aa  240  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  67.65 
 
 		 170 aa  239  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  59.41 
 
 		 172 aa  225  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  62.35 
 
 		 170 aa  224  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  58.24 
 
 		 172 aa  218  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  60.82 
 
 		 172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  60.82 
 
 		 172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 175 aa  206  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  53.53 
 
 		 170 aa  200  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  59.38 
 
 		 176 aa  199  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  55.29 
 
 		 170 aa  197  7.999999999999999e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 170 aa  192  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 172 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 		 173 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 		 182 aa  187  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 		 171 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 175 aa  185  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 174 aa  184  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 		 173 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 		 172 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 		 174 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 		 171 aa  178  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 		 170 aa  177  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 187 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 187 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 187 aa  174  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 170 aa  174  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 172 aa  174  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0497  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.742896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 		 175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  50.61 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl276  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 170 aa  170  7.999999999999999e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000600787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 		 197 aa  168  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 183 aa  167  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 		 172 aa  167  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 172 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 172 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 		 176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 		 176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 		 179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 		 173 aa  164  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 183 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 183 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 183 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 183 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  46.3 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  48.47 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 		 168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 		 424 aa  161  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  47.47 
 
 		 181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  48.47 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 184 aa  160  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 		 176 aa  160  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>